More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl1413 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  97.14 
 
 
315 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  646    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  73.65 
 
 
314 aa  488  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  32.73 
 
 
347 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.23 
 
 
253 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  26.48 
 
 
251 aa  94  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
648 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  28.02 
 
 
253 aa  92.4  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  30.11 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  32.17 
 
 
253 aa  89.7  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
254 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
253 aa  89.4  8e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
254 aa  89  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
254 aa  89  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  32.87 
 
 
253 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  32.87 
 
 
253 aa  89  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  28.11 
 
 
639 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
659 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
258 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
630 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  43.16 
 
 
254 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  27.24 
 
 
630 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
254 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
343 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  31.49 
 
 
274 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  29.51 
 
 
257 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
343 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  40.78 
 
 
245 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  30 
 
 
342 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  31.16 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  32.22 
 
 
342 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
304 aa  81.3  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  25.95 
 
 
253 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  37.66 
 
 
250 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  42.7 
 
 
259 aa  78.2  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  37.66 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  40.2 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
342 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  43.18 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
251 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  25.2 
 
 
342 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
343 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.91 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
343 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  27.69 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  39.05 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  39.05 
 
 
244 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  39.05 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 
245 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  39.05 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  39.05 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  39.05 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  39.05 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  30.15 
 
 
398 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  39.05 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  32.52 
 
 
256 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  38.1 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 
241 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  26 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 
107 aa  74.7  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
342 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  27.75 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  32.23 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  35.48 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  32.65 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 
377 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  27.03 
 
 
252 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  52.54 
 
 
63 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.19 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  34.55 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 
254 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 
238 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  42.39 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  31.97 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  42.39 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  44.62 
 
 
429 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  38.3 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.94 
 
 
254 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
250 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>