More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3106 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  100 
 
 		 257 aa  516  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  92.94 
 
 		 255 aa  477  1e-134  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  92.16 
 
 		 255 aa  471  1e-132  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  44.66 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  45.06 
 
 		 256 aa  219  3.9999999999999997e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  44.58 
 
 		 256 aa  217  2e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  44.62 
 
 		 256 aa  211  7e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 262 aa  194  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 253 aa  100  3e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 247 aa  89.4  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  45.63 
 
 		 107 aa  87.4  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 247 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 251 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 253 aa  86.7  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 247 aa  86.3  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 254 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 253 aa  85.9  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 253 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 247 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  29.61 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  29.51 
 
 		 315 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 251 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  28.96 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  27.2 
 
 		 243 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  31.34 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  26.8 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  26.8 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  26.95 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  26.8 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  26.4 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  33.05 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  33.05 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  26.4 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  33.05 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 241 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.03 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 342 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 		 258 aa  71.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 268 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 245 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  27.54 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 258 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 343 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 343 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  33.33 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 659 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  31.73 
 
 		 253 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 648 aa  67  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  32.98 
 
 		 342 aa  67  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  27.52 
 
 		 271 aa  67  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  29.82 
 
 		 253 aa  66.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  31.54 
 
 		 395 aa  66.6  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  35.92 
 
 		 245 aa  65.9  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  27.34 
 
 		 249 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7229  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 272 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385629 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  28.7 
 
 		 274 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  34.04 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  26.56 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.83 
 
 		 262 aa  62  0.000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 238 aa  62  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 256 aa  62  0.000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 639 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  49.18 
 
 		 64 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  38.03 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  25.35 
 
 		 259 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  62  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  32.38 
 
 		 244 aa  60.8  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  28.06 
 
 		 169 aa  61.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  30.36 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  28.81 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>