More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0950 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
343 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  98.41 
 
 
343 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
63 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  93.65 
 
 
342 aa  121  4e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
343 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
342 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  90.48 
 
 
343 aa  117  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  88.89 
 
 
342 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  88.89 
 
 
342 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  88.89 
 
 
342 aa  117  6e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  90.32 
 
 
342 aa  117  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  73.02 
 
 
342 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  70.97 
 
 
639 aa  94.7  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  70.97 
 
 
630 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  70.97 
 
 
630 aa  94.4  5e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  70.97 
 
 
659 aa  94  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  69.35 
 
 
648 aa  92  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  54.1 
 
 
271 aa  74.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  54.24 
 
 
314 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  54.1 
 
 
257 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  52.54 
 
 
315 aa  71.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  51.67 
 
 
259 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  50.85 
 
 
315 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  51.72 
 
 
278 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  43.55 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  57.63 
 
 
269 aa  68.2  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  53.23 
 
 
252 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 
354 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  55.74 
 
 
288 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  45.9 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  51.67 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  50 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
258 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  51.72 
 
 
377 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  47.54 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  51.67 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 
137 aa  65.5  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  48.33 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  43.55 
 
 
253 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  50.85 
 
 
347 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  48.28 
 
 
336 aa  65.5  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  51.67 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  50.85 
 
 
270 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  48.39 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  48.28 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 
253 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  50 
 
 
429 aa  64.7  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  45.16 
 
 
244 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 
334 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  44.07 
 
 
249 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
133 aa  64.3  0.0000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  45.16 
 
 
243 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
252 aa  63.9  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
253 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  45.16 
 
 
243 aa  63.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 
254 aa  63.5  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
254 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
253 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  45.16 
 
 
243 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 
256 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  45.16 
 
 
243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
252 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  45.16 
 
 
243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  45.16 
 
 
243 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  43.33 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 
253 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 
158 aa  62.8  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  49.21 
 
 
252 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  43.55 
 
 
244 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  53.45 
 
 
253 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 
131 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  45.16 
 
 
243 aa  62.8  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 
254 aa  62.4  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
241 aa  61.6  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 
256 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  46.55 
 
 
398 aa  61.6  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
155 aa  61.6  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  41.67 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  45 
 
 
132 aa  60.8  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
135 aa  61.2  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 
333 aa  60.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  52.54 
 
 
188 aa  60.8  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 
251 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  48.28 
 
 
256 aa  60.5  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>