More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1137 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  100 
 
 		 395 aa  821    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  41.03 
 
 		 398 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  33.21 
 
 		 256 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2461  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 265 aa  125  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3682  hypothetical protein  27.59 
 
 		 315 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000635868  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3407  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  27.38 
 
 		 322 aa  93.6  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000119678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3444  hypothetical protein  27.38 
 
 		 322 aa  93.2  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000102357  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3714  hypothetical protein  27.38 
 
 		 315 aa  92.8  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000001291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 262 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  91.7  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3356  ubiquinone/menaquinone methyltransferase  28.77 
 
 		 318 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000127941  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 254 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 253 aa  91.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 253 aa  92  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 253 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3687  hypothetical protein  26.44 
 
 		 315 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000572163  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 253 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 253 aa  90.5  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1554  hypothetical protein  29.63 
 
 		 315 aa  90.1  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000923024  normal  0.0128521 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  36.3 
 
 		 251 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 256 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3762  hypothetical protein  28.3 
 
 		 315 aa  87  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000334692  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  40.34 
 
 		 250 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3341  methyltransferase type 11  26.82 
 
 		 315 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000506511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 251 aa  86.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  38.66 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  37.19 
 
 		 256 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 256 aa  80.9  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 256 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4175  methyltransferase type 11  27.66 
 
 		 279 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  35.43 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  32.23 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.04 
 
 		 268 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  32.81 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  32.23 
 
 		 315 aa  73.6  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  43.82 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  36.28 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  31.62 
 
 		 347 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  35.4 
 
 		 247 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3676  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1749  MerR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.682518  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3013  biotin biosynthesis protein BioC  30.37 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.755782  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  37.62 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1511  regulatory protein, MerR  47.14 
 
 		 178 aa  70.5  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.31333  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  31.58 
 
 		 254 aa  69.3  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  32.46 
 
 		 249 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34.55 
 
 		 250 aa  69.3  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 253 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  30.95 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1562  transcriptional regulator  33.65 
 
 		 160 aa  68.2  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.39 
 
 		 275 aa  68.2  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  37.62 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  37.62 
 
 		 244 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  37.62 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 255 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  37.62 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  37.62 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  37.62 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  37.62 
 
 		 243 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 268 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  29.71 
 
 		 252 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  31.54 
 
 		 257 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  37.62 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 155 aa  66.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.63 
 
 		 243 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 648 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 257 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4899  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.69 
 
 		 269 aa  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 257 aa  65.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 252 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  35.45 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  46.97 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  34.21 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0844  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  32.41 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21420  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  28.3 
 
 		 233 aa  64.3  0.000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0478514  hitchhiker  0.0000156795 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  34.91 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  32.23 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  26.25 
 
 		 275 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 133 aa  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  48.48 
 
 		 157 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  47.69 
 
 		 155 aa  63.5  0.000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3565  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 288 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0597745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>