More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1645 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 154 aa  301  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  84.52 
 
 		 155 aa  253  9e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 137 aa  139  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  63.64 
 
 		 131 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  58.06 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  61.4 
 
 		 136 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  57.02 
 
 		 135 aa  131  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  53.91 
 
 		 133 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 125 aa  111  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  47.14 
 
 		 165 aa  111  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 144 aa  110  6e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  48.74 
 
 		 134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 133 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 186 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  52.24 
 
 		 141 aa  108  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  51.67 
 
 		 133 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  48.18 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 152 aa  87.4  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 180 aa  85.5  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 		 138 aa  81.3  0.000000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.44 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.52 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 141 aa  77.8  0.00000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 154 aa  77  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 136 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.52 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1555  MerR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 193 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.949248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  42.7 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 136 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  39.52 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 		 149 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9863  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.08 
 
 		 147 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3523  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  54.29 
 
 		 147 aa  73.9  0.0000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 179 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  33.08 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1339  transcriptional regulator of MerR family protein  33.9 
 
 		 130 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 171 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.38 
 
 		 157 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  48.81 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  40.23 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  40.23 
 
 		 159 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  33.9 
 
 		 153 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  32.31 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  42.53 
 
 		 144 aa  72  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 159 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.23 
 
 		 157 aa  72  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 		 132 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.06 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  48.53 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 167 aa  71.6  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  36.13 
 
 		 148 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  46.43 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 342 aa  71.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 173 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4158  MerR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 135 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.144769 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0660  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 137 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 135 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 171 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  39.08 
 
 		 176 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  45.35 
 
 		 186 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 152 aa  70.9  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>