More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3239 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 156 aa  315  1e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  50.85 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  52.03 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  46.09 
 
 		 133 aa  115  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  44.8 
 
 		 134 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  47.01 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  41.98 
 
 		 137 aa  105  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  47.83 
 
 		 136 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  52.89 
 
 		 131 aa  103  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 155 aa  100  6e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  53.26 
 
 		 147 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  43.9 
 
 		 133 aa  96.7  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 186 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  46.03 
 
 		 141 aa  95.9  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 165 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 144 aa  92.8  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  59.09 
 
 		 154 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 254 aa  70.1  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 158 aa  69.3  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 159 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 157 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 157 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3886  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.648362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  39.44 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  34.69 
 
 		 142 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  31.48 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  42.65 
 
 		 252 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 156 aa  67  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5502  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 163 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5221  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5053  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5069  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.587051  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 144 aa  67  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5621  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5464  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5166  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5550  transcriptional regulator, MerR family  35.24 
 
 		 135 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.11 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5494  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 135 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 171 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  44.12 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5456  transcriptional regulator, MerR family  34.29 
 
 		 135 aa  65.1  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  45.45 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  31.48 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 		 138 aa  65.1  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0987  MerR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 160 aa  64.3  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.758767  hitchhiker  0.000750648 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  42.03 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 354 aa  63.9  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  41.18 
 
 		 278 aa  63.9  0.0000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  27.61 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  36.71 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  31.11 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  28.36 
 
 		 141 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 139 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 334 aa  62.4  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  41.54 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 336 aa  62.4  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 166 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>