More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3486 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 135 aa  265  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  72.03 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 137 aa  146  7e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0525  putative transcriptional regulator, MerR family  61.16 
 
 		 147 aa  140  7e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0178502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  56.2 
 
 		 155 aa  130  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  58.68 
 
 		 131 aa  121  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  56.2 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  51.56 
 
 		 133 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  57.81 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  54.31 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  52.07 
 
 		 125 aa  110  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  52.34 
 
 		 165 aa  110  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  50.41 
 
 		 133 aa  107  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3239  transcriptional regulator, MerR family  46.9 
 
 		 156 aa  106  1e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000227315  hitchhiker  0.000316604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3925  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 147 aa  104  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.847498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  53.12 
 
 		 141 aa  103  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2780  MerR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.891963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4917  MerR family transcriptional regulator  51.3 
 
 		 186 aa  100  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2779  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 180 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.573882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4918  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 152 aa  75.5  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502538 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1256  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 142 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.44 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 136 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  42.53 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2494  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.453842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3620  transcriptional regulator, MerR family  37.18 
 
 		 148 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 136 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.52 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  50.75 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 136 aa  70.9  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 163 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 182 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 166 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  40.74 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 169 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  39.13 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  46.67 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  47.76 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1599  MerR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  40.87 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  39.13 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46190  cadmium responsive transcriptional regulator, merR family  42.15 
 
 		 152 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.719382  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  39.13 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  39.13 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 147 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  49.25 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  39.13 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5946  MerR family transcriptional regulator PbrR  47.06 
 
 		 145 aa  68.6  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 158 aa  68.6  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4523  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5359  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  37.38 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000328  HTH-type transcriptional regulator CueR  44.12 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000000737909  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2104  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2391  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  39.53 
 
 		 151 aa  68.2  0.00000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0284263  normal  0.3053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  32.31 
 
 		 303 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0198  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  49.25 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  45.59 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  42.71 
 
 		 141 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2399  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000424023  normal  0.796089 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  50.75 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3828  MerR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 251 aa  67.4  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 138 aa  67.4  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2572  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 141 aa  67  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.957862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  38.78 
 
 		 142 aa  67  0.00000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 268 aa  67  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 132 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  38.6 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>