More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_34160 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 278 aa  551  1e-156  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  52.14 
 
 		 274 aa  283  3.0000000000000004e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  54.37 
 
 		 271 aa  270  2e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  50.78 
 
 		 272 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  51.6 
 
 		 259 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  52.28 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 251 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  43.03 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  46.47 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  44.08 
 
 		 251 aa  195  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 252 aa  188  8e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.41 
 
 		 252 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  43.95 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  42.04 
 
 		 253 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 268 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  38.49 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 257 aa  158  1e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  38.08 
 
 		 270 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  32.53 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  37.05 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  30.12 
 
 		 254 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  27.82 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  26.02 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  26.58 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  27.5 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  30.88 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  27.43 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  27 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 238 aa  110  3e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  27.08 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  27.08 
 
 		 243 aa  110  3e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  27.08 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  27 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 258 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  27.69 
 
 		 250 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  26.16 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  27.43 
 
 		 243 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  31.67 
 
 		 252 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 253 aa  107  2e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  30.77 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  26.58 
 
 		 249 aa  104  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 242 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 241 aa  103  4e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 250 aa  99.8  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 258 aa  96.3  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  27.05 
 
 		 256 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  23.97 
 
 		 246 aa  92.8  6e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 253 aa  90.9  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  44.88 
 
 		 429 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 342 aa  90.1  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 250 aa  89  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 251 aa  87.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  24 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  26.78 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 		 252 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 343 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  37.86 
 
 		 148 aa  80.1  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.26 
 
 		 342 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 343 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 639 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 342 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  30.7 
 
 		 252 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  40.19 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 254 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  52.05 
 
 		 336 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 345 aa  72.8  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  33.96 
 
 		 253 aa  72.8  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 354 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  20 
 
 		 250 aa  71.6  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  40.43 
 
 		 333 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  50.68 
 
 		 336 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 256 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  33.03 
 
 		 314 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 339 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8151  putative transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.963489 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>