More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2999 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 336 aa  640    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  89.88 
 
 		 336 aa  535  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  69.09 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  66.67 
 
 		 354 aa  394  1e-109  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  55.49 
 
 		 334 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  62.01 
 
 		 333 aa  326  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  49.39 
 
 		 326 aa  270  2.9999999999999997e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  47.9 
 
 		 339 aa  242  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  27.76 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  45.63 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  44.23 
 
 		 254 aa  79  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 343 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 343 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 342 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 251 aa  75.1  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 342 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  54.29 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  35.86 
 
 		 271 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 253 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  41.49 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  46.59 
 
 		 278 aa  73.2  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 253 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 251 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  29.05 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  29.05 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 253 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  45.59 
 
 		 134 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 639 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  51.47 
 
 		 258 aa  69.3  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0034  MerR family transcriptional regulator  52.46 
 
 		 144 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 		 252 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 157 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 63 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  31.93 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 134 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 132 aa  68.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 377 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 630 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  46.48 
 
 		 429 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 254 aa  67  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  50.82 
 
 		 134 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 125 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  49.21 
 
 		 147 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 125 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 125 aa  67  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 253 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  39.56 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3210  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 136 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.303617  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0802  MerR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0285806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  45 
 
 		 133 aa  65.9  0.0000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  40.43 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 136 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  46.77 
 
 		 136 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  50.82 
 
 		 154 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  50.82 
 
 		 154 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1160  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 133 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.392851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0032  MerR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 134 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  40.3 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  32 
 
 		 1094 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.3 
 
 		 132 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0035  transcriptional regulator, MerR family  49.18 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.987448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4873  MerR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 141 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  37.31 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 130 aa  65.1  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0303  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 154 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00540997  normal  0.988288 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0017  MerR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.801756 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  37.96 
 
 		 142 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  38.89 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  38.89 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5373  transcriptional regulator, MerR family  41.56 
 
 		 145 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  37.11 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  39.13 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4044  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 271 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0218982 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>