More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0760 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 267 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2144  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 272 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 272 aa  75.5  0.0000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1458  MerR family transcriptional regulator  49.35 
 
 		 161 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0168574  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  33.67 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  31.15 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  41.51 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2655  zinc-responsive transcriptional regulator  45.71 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3611  transcriptional regulator, MerR family  38.83 
 
 		 267 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0705  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.92 
 
 		 135 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  46.48 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2831  MerR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 175 aa  67.4  0.0000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.116752 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3788  MerR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 144 aa  67  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.318416  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  37.25 
 
 		 347 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0478  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 146 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  35.92 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2326  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 150 aa  67  0.0000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2231  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2270  regulatory protein MerR  35.48 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  36.26 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.37 
 
 		 259 aa  66.6  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  34.31 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  39.42 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0226  transcriptional regulator, MerR family  38.14 
 
 		 276 aa  65.9  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814651  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  35.58 
 
 		 159 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  29.24 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0098  MerR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 279 aa  65.9  0.0000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000252188  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5012  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.147011  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  35.58 
 
 		 139 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.55 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.55 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 343 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  33.55 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4808  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.820733 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.36 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 281 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  36.36 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3731  transcriptional regulator, MerR family  30.91 
 
 		 160 aa  64.3  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  33.55 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  32.61 
 
 		 148 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  33.55 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  33.55 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  31.25 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002186  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 132 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3108  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 154 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.798682  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  32.89 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 270 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 343 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  41.24 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  27.34 
 
 		 249 aa  62.8  0.000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4163  transcriptional regulator, MerR family  31.43 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  34.91 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 241 aa  62  0.000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2780  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000880145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1484  MerR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 126 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.944176  normal  0.368372 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1915  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 136 aa  61.6  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 237 aa  61.2  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 343 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 343 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 342 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 247 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  37.36 
 
 		 254 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05447  transcription regulator protein  29.09 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.015587 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2545  transcriptional regulator, MerR family  36.89 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3299  MerR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 149 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0169089  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  28.35 
 
 		 252 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 141 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3050  transcriptional regulator, MerR family protein  36.67 
 
 		 273 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  32.71 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  34.62 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>