More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0339 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
253 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  31.86 
 
 
314 aa  113  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  32.23 
 
 
315 aa  108  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  31.75 
 
 
315 aa  106  4e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  38.96 
 
 
256 aa  105  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
256 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
255 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  29 
 
 
262 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
256 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  28.79 
 
 
253 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 
256 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  32.69 
 
 
257 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
342 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  29.15 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
254 aa  99  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  29.08 
 
 
254 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 
253 aa  97.8  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  29.44 
 
 
253 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  31.41 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
245 aa  97.1  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 
253 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
258 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31.63 
 
 
342 aa  96.3  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  32.62 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  28.12 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  29.77 
 
 
343 aa  93.6  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  28.12 
 
 
243 aa  93.2  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  28.12 
 
 
243 aa  93.6  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  28.12 
 
 
243 aa  92.8  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 
639 aa  92  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 
288 aa  92  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  27.13 
 
 
249 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.3 
 
 
342 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  27.24 
 
 
253 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  27.78 
 
 
243 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  28.12 
 
 
243 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  31.94 
 
 
253 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  28.4 
 
 
241 aa  90.1  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  28.34 
 
 
243 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  30.63 
 
 
648 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  27.84 
 
 
244 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
343 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  28.35 
 
 
244 aa  89  7e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
343 aa  87.8  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
342 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
342 aa  85.9  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  28.12 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  32.87 
 
 
398 aa  85.9  6e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  33.82 
 
 
253 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
630 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
630 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  30.8 
 
 
659 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  31.22 
 
 
255 aa  82  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 
107 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  30.38 
 
 
251 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  33.08 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 
256 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  29.38 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  42.86 
 
 
262 aa  79.3  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  29.52 
 
 
254 aa  78.6  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  43.69 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  30.97 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  30.04 
 
 
254 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  27.64 
 
 
270 aa  77  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.79 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  30.15 
 
 
253 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 
252 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.82 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  43 
 
 
254 aa  75.9  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  29.68 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  29.5 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  29.69 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
247 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  26.91 
 
 
254 aa  73.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  27.16 
 
 
270 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  27 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  30.32 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
304 aa  73.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  28.09 
 
 
250 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  41.18 
 
 
257 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  31.5 
 
 
395 aa  72.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 
274 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  29.03 
 
 
247 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
253 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  43.3 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  48.61 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  28.3 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>