More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_3712 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
251 aa  510  1e-144  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  73.71 
 
 
253 aa  374  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  73.71 
 
 
251 aa  376  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  73.31 
 
 
253 aa  376  1e-103  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  72.11 
 
 
253 aa  370  1e-101  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  71.31 
 
 
254 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  71.71 
 
 
254 aa  366  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  71.71 
 
 
254 aa  366  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  71.71 
 
 
253 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  71.31 
 
 
253 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  71.71 
 
 
253 aa  365  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  41.8 
 
 
252 aa  199  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  40.16 
 
 
252 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  34.39 
 
 
253 aa  144  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  29.3 
 
 
342 aa  95.9  5e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  31.07 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  32.13 
 
 
256 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
256 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
256 aa  92  8e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  42.45 
 
 
254 aa  91.3  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
343 aa  91.7  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
342 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  40.16 
 
 
255 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
342 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
342 aa  90.1  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  28.84 
 
 
342 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  30.92 
 
 
256 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
343 aa  89.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
343 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  32.26 
 
 
342 aa  88.6  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
343 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.31 
 
 
253 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  34.31 
 
 
398 aa  86.3  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  35.07 
 
 
395 aa  86.3  4e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
342 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  37.5 
 
 
262 aa  85.1  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  38.79 
 
 
250 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
630 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  31.47 
 
 
315 aa  84.3  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  31.47 
 
 
315 aa  84  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
659 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  38.79 
 
 
256 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  28.14 
 
 
630 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  41.23 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  38.21 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
648 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  34.11 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  28.05 
 
 
254 aa  82  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 
254 aa  81.3  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  37.62 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  36.89 
 
 
257 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  30.89 
 
 
243 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  32.45 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  36.46 
 
 
244 aa  80.5  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  52.44 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  57.58 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  52.44 
 
 
247 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  45.37 
 
 
245 aa  79  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
252 aa  79  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  31.62 
 
 
347 aa  78.6  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  50.63 
 
 
107 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
245 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.63 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  33.87 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  33.87 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  41.76 
 
 
259 aa  77  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  33.87 
 
 
243 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  34.82 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  34.82 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  27.05 
 
 
254 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  30.35 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 
253 aa  75.5  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
258 aa  75.5  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  33.61 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  33.06 
 
 
244 aa  75.1  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  29.84 
 
 
243 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 
284 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  61.02 
 
 
64 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 
255 aa  73.9  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35820  predicted transcriptional regulator  50.75 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
639 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  26.75 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 
288 aa  73.2  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  44.93 
 
 
249 aa  72.8  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  44.93 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 
304 aa  72.4  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  33 
 
 
271 aa  72  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
377 aa  72  0.000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  46.27 
 
 
133 aa  71.2  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  36.8 
 
 
256 aa  71.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  35.85 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>