More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_23430 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  540  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  57.63 
 
 		 274 aa  305  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  55.73 
 
 		 259 aa  270  1e-71  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  54.37 
 
 		 278 aa  270  2e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  56.05 
 
 		 254 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  46.59 
 
 		 272 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 253 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  48.24 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 251 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  46.59 
 
 		 253 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 251 aa  199  5e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  47.6 
 
 		 254 aa  192  5e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  42.8 
 
 		 252 aa  186  3e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 		 253 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  39.85 
 
 		 268 aa  186  5e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  44.22 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  43.6 
 
 		 252 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 257 aa  183  3e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  41.26 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  33.2 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  40.78 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  33.2 
 
 		 254 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 258 aa  128  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  35.32 
 
 		 255 aa  127  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  31.08 
 
 		 254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  35.2 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  33.74 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  33.74 
 
 		 243 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  31.17 
 
 		 254 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  33.74 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  33.74 
 
 		 243 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  31.3 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  33.74 
 
 		 243 aa  120  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  32.93 
 
 		 244 aa  120  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 241 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  33.33 
 
 		 243 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  31.62 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 245 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  30.43 
 
 		 245 aa  104  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 256 aa  103  3e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 270 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  29.6 
 
 		 256 aa  99.8  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  31.8 
 
 		 252 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  25.4 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  29.69 
 
 		 254 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  99  8e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 253 aa  97.1  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 429 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  31.8 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 377 aa  92.4  7e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 258 aa  88.2  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 343 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 343 aa  87.8  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.92 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  27.45 
 
 		 250 aa  87.8  2e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  25.31 
 
 		 249 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  30.87 
 
 		 342 aa  86.3  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.4 
 
 		 262 aa  85.9  6e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 343 aa  85.5  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 284 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  45.36 
 
 		 342 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  47.19 
 
 		 334 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  55.41 
 
 		 339 aa  80.1  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 288 aa  79  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  29.39 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  43.27 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  22.76 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  22.76 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 345 aa  75.5  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 253 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  44.57 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  33.73 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 63 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  52.94 
 
 		 326 aa  73.9  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  39.82 
 
 		 648 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  37.25 
 
 		 251 aa  73.2  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 333 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 336 aa  72.4  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  33 
 
 		 251 aa  72  0.000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4400  transcriptional regulator, MerR family  38.35 
 
 		 303 aa  72  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.462564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  32.35 
 
 		 253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 267 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 336 aa  71.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>