More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS668_2107 on replicon NC_009074
Organism: Burkholderia pseudomallei 668



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  100 
 
 
342 aa  687    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  90.64 
 
 
343 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  90.35 
 
 
343 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  74.56 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  73.1 
 
 
342 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  72.01 
 
 
343 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  73.1 
 
 
342 aa  510  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  73.39 
 
 
342 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  72.22 
 
 
342 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  71.43 
 
 
343 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  55.03 
 
 
342 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  42.57 
 
 
648 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  39.94 
 
 
639 aa  216  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  40.76 
 
 
659 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
630 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  40.47 
 
 
630 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1532  MerR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
604 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1556  MerR family transcriptional regulator  36.83 
 
 
604 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.486456  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0610  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.303247  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1328  MerR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
604 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  93.65 
 
 
63 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
253 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  29.91 
 
 
251 aa  92.8  9e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  29.3 
 
 
253 aa  91.3  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  30.37 
 
 
253 aa  90.9  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  29.3 
 
 
253 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
254 aa  90.1  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
253 aa  90.1  5e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  28.24 
 
 
253 aa  89.7  7e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  27.78 
 
 
254 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  27.78 
 
 
253 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  30.87 
 
 
271 aa  86.3  8e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  26.51 
 
 
251 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  30 
 
 
315 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  38.76 
 
 
354 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  39.62 
 
 
274 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2451  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 
339 aa  79.7  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  29.44 
 
 
315 aa  79.3  0.00000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  39.2 
 
 
270 aa  79.3  0.00000000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  25.12 
 
 
252 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  29.26 
 
 
278 aa  79  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  25.12 
 
 
252 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  26.67 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  44 
 
 
288 aa  77.4  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  33.07 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  43.59 
 
 
314 aa  77  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4579  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.923905  decreased coverage  0.00324593 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 
253 aa  75.5  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1491  regulatory protein MerR  33.52 
 
 
326 aa  75.5  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  28.33 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  28.15 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  42.06 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 
251 aa  73.6  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
136 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4624  transcriptional regulator, MerR family  36.07 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  29.76 
 
 
252 aa  73.2  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 
138 aa  72.8  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
268 aa  72.8  0.000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
429 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  42.73 
 
 
269 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 
127 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  42.86 
 
 
270 aa  71.2  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
345 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 
254 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  28.16 
 
 
336 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.54 
 
 
252 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3218  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2075  MerR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.491392 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6523  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
128 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0471751  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  23.79 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2080  transcriptional regulator, MerR family  27.5 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.632784  hitchhiker  0.000000000732695 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6757  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 
128 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.288009  normal  0.0279244 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3434  MerR family transcriptional regulator  34.96 
 
 
128 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.87421  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  37.38 
 
 
154 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1961  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
134 aa  70.5  0.00000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.778807  normal  0.944936 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  36.89 
 
 
238 aa  70.1  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  39.56 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35600  predicted transcriptional regulator  32.14 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172761  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0073  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.45 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  37.63 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0653  regulatory protein, MerR  37.96 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  33.33 
 
 
347 aa  68.9  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  29.09 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  29.09 
 
 
246 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  32.16 
 
 
377 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 
132 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  40.37 
 
 
129 aa  68.9  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4853  transcriptional regulator, MerR family  51.47 
 
 
81 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.869055  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>