More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1012 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  100 
 
 		 429 aa  850    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  94.52 
 
 		 377 aa  623  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3108  Methyltransferase type 11  67.21 
 
 		 246 aa  295  1e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  50.81 
 
 		 258 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0837  Methyltransferase type 11  48.99 
 
 		 253 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.702425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  51.81 
 
 		 259 aa  182  7e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4208  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 		 258 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  56.56 
 
 		 251 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  56.2 
 
 		 254 aa  134  3e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  54.55 
 
 		 253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 274 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  47.66 
 
 		 258 aa  120  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  49.59 
 
 		 252 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 254 aa  117  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  51.24 
 
 		 253 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  49.63 
 
 		 259 aa  117  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  47.93 
 
 		 253 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  50.41 
 
 		 252 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  45.6 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  46.72 
 
 		 251 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  31.23 
 
 		 264 aa  107  4e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 260 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 		 271 aa  103  5e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 268 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 258 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  44.88 
 
 		 278 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 257 aa  97.1  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  35.54 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  35.54 
 
 		 243 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  35.54 
 
 		 243 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  34.71 
 
 		 243 aa  94.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  34.71 
 
 		 243 aa  94  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  42.4 
 
 		 272 aa  94  5e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  34.71 
 
 		 243 aa  93.6  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  34.71 
 
 		 243 aa  93.6  7e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  33.88 
 
 		 244 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 245 aa  92.8  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  34.71 
 
 		 244 aa  92.8  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  35.61 
 
 		 255 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 241 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 258 aa  90.9  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  25.24 
 
 		 249 aa  90.9  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 254 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 250 aa  87.4  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  40.57 
 
 		 256 aa  86.7  8e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 		 254 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  37.16 
 
 		 244 aa  86.3  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  47.31 
 
 		 256 aa  85.9  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  26.15 
 
 		 254 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  41.35 
 
 		 270 aa  81.6  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  39.67 
 
 		 252 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 250 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  36.36 
 
 		 262 aa  78.2  0.0000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  34.95 
 
 		 250 aa  77  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 254 aa  77  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0877  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  34.19 
 
 		 249 aa  76.3  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0931  MerR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 247 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  37.29 
 
 		 245 aa  75.9  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 284 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  44.94 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0837  MerR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  40.78 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0829  MerR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 342 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1021  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10693e-29 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 288 aa  73.6  0.000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.29 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 253 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  27.96 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  27.96 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 225 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 254 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 253 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  33.92 
 
 		 342 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  27.42 
 
 		 251 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1107  transcriptional regulator, MerR family  33.66 
 
 		 247 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00363233  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  22.66 
 
 		 395 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  43.82 
 
 		 343 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 256 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  40.91 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 262 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  50.75 
 
 		 138 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  21.18 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  42.65 
 
 		 314 aa  68.2  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4910  putative transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.48977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 342 aa  67.8  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  46.48 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>