More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2496 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  53.6 
 
 		 253 aa  286  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  54 
 
 		 255 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  49.2 
 
 		 254 aa  256  4e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  51.2 
 
 		 254 aa  255  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  46.8 
 
 		 254 aa  245  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2871  TipAS antibiotic-recognition  55.21 
 
 		 170 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 241 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  36.29 
 
 		 243 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  36.29 
 
 		 243 aa  159  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  36.69 
 
 		 243 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  36.29 
 
 		 243 aa  159  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  35.89 
 
 		 243 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  35.89 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  35.89 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  35.48 
 
 		 244 aa  155  8e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  35.48 
 
 		 244 aa  154  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 245 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  39.68 
 
 		 251 aa  151  8.999999999999999e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  36.47 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  40.78 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 252 aa  142  7e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  37.1 
 
 		 278 aa  141  9e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.2 
 
 		 254 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  37.45 
 
 		 253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  36.86 
 
 		 259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  33.86 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  35.71 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 251 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  36.22 
 
 		 253 aa  123  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  33.6 
 
 		 258 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  37.74 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 250 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  32.67 
 
 		 274 aa  118  7e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  29.13 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  34.27 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 258 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  29.76 
 
 		 249 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  34.51 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 270 aa  113  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  33.2 
 
 		 252 aa  113  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  30.65 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.17 
 
 		 262 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 253 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  29.34 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  29.96 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  110  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 261 aa  107  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  36.19 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.85 
 
 		 272 aa  98.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  30.56 
 
 		 244 aa  91.7  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  47.87 
 
 		 288 aa  90.5  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  30.08 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  33.59 
 
 		 253 aa  87.8  2e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  30.83 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  54.41 
 
 		 377 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  44.76 
 
 		 254 aa  71.6  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  32.23 
 
 		 252 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  24.56 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  50.68 
 
 		 429 aa  70.1  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  36.27 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  29.27 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  50.77 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5021  MerR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5003  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 342 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 342 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  48.53 
 
 		 342 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  51.47 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3566  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4650  transcriptional regulator, MerR family  47.14 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.637642  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 250 aa  62.8  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2659  transcriptional regulator, MerR family  47.76 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.587322  normal  0.281971 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 343 aa  62  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3106  regulator of pmrA, putative  25.35 
 
 		 257 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0273598  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  33.93 
 
 		 314 aa  62  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0245  transcriptional regulator, MerR family  24.63 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00512795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4703  MerR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.279975  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3105  transcriptional regulator, MerR family  25.87 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154295  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2999  regulatory protein, MerR  47.14 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.645753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>