More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_24960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  548  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  47.58 
 
 		 257 aa  249  3e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  46.95 
 
 		 268 aa  246  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  47.88 
 
 		 253 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  46.95 
 
 		 251 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  44.36 
 
 		 258 aa  214  8e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  45.95 
 
 		 253 aa  208  7e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  45.14 
 
 		 259 aa  201  9.999999999999999e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  43.68 
 
 		 253 aa  199  5e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  46.33 
 
 		 254 aa  196  3e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  45.8 
 
 		 251 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  40.47 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  45.04 
 
 		 251 aa  182  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  40.47 
 
 		 252 aa  181  8.000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  38.95 
 
 		 274 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 254 aa  176  5e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  41.26 
 
 		 271 aa  171  1e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  38.08 
 
 		 278 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  26.38 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  29.57 
 
 		 254 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  29.48 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  29.48 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  29.48 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  29.48 
 
 		 243 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  29.1 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  29.48 
 
 		 243 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  29.85 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  29.1 
 
 		 243 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  29.1 
 
 		 244 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  28.12 
 
 		 254 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 241 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  27.84 
 
 		 255 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  29.53 
 
 		 272 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  34.51 
 
 		 259 aa  102  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  26.64 
 
 		 254 aa  100  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  30.28 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 238 aa  96.3  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 		 254 aa  92.4  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 237 aa  91.7  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  27.2 
 
 		 244 aa  89.4  6e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  27.76 
 
 		 270 aa  86.3  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.64 
 
 		 252 aa  85.5  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1629  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  32.39 
 
 		 148 aa  84  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.651813  normal  0.0608845 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 258 aa  82.4  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  24.44 
 
 		 262 aa  82  0.000000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  25.47 
 
 		 253 aa  82  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 256 aa  80.1  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  41.35 
 
 		 429 aa  75.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  26.36 
 
 		 245 aa  75.9  0.0000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  41.09 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  29.53 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  45.56 
 
 		 343 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 343 aa  72  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 342 aa  72  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  42.86 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 342 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 343 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 250 aa  70.5  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  27.96 
 
 		 250 aa  69.7  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  40.71 
 
 		 342 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1729  MerR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 659 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0980  MerR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 648 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0811  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.872651  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2665  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 639 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0545  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 630 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  23.28 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  27.7 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  19.54 
 
 		 250 aa  65.9  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0950  MerR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 63 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  22.22 
 
 		 250 aa  65.1  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1724  MerR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 134 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 253 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 253 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2481  transcriptional regulator, MerR family  38.37 
 
 		 269 aa  64.3  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.564945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  29.15 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  32.11 
 
 		 139 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  51.52 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  30 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  30 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  30.39 
 
 		 347 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  31.73 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 190 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>