118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1826 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1826  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
256 aa  523  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  37.77 
 
 
253 aa  161  9e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
254 aa  161  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  37.07 
 
 
255 aa  154  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 
254 aa  146  4.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2871  TipAS antibiotic-recognition  37.18 
 
 
170 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  29.54 
 
 
254 aa  96.7  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  30.52 
 
 
243 aa  94  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  30.52 
 
 
244 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  30.05 
 
 
243 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  30.05 
 
 
243 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
258 aa  92  9e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  30.05 
 
 
243 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  30.05 
 
 
243 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
245 aa  91.3  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  30.05 
 
 
244 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  29.58 
 
 
243 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  29.11 
 
 
243 aa  88.2  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  29.11 
 
 
241 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  28.11 
 
 
249 aa  86.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  28.44 
 
 
252 aa  85.9  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  26.98 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  29.86 
 
 
249 aa  83.2  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  28.24 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  28.24 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  24.89 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  24.66 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  26.76 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  25.57 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  23.26 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  26.17 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  25.74 
 
 
278 aa  69.3  0.00000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  26.48 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  26.05 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  25.81 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  24.43 
 
 
259 aa  66.2  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 
258 aa  65.1  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  23.87 
 
 
257 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
268 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  23.83 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  24.14 
 
 
237 aa  62  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  24.88 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  21.62 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  23.14 
 
 
274 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  27.6 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  24.31 
 
 
256 aa  58.9  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64500  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 
270 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  24.41 
 
 
250 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6769  transcriptional regulator, MerR family  25.23 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.220453  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  23.04 
 
 
242 aa  56.6  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  28.95 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  24.35 
 
 
271 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  29.63 
 
 
250 aa  55.5  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  20.36 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  20.36 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0134  transcriptional regulator, MerR family  26.34 
 
 
253 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  21 
 
 
251 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  34.15 
 
 
284 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  32.5 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  25.69 
 
 
244 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4799  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1629  transcriptional regulator, MerR family  48 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0882685  normal  0.393491 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
252 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19550  serine/threonine protein phosphatase  33.73 
 
 
361 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.17725  normal  0.381768 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1816  MerR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
154 aa  49.3  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0245036  normal  0.855302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  32.97 
 
 
249 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0760  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0248072  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
288 aa  47.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  26.67 
 
 
261 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5600  putative transcriptional regulator  36.46 
 
 
270 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1527  MerR family transcriptional regulator  30.85 
 
 
276 aa  46.6  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  21.49 
 
 
238 aa  45.4  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3667  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 
276 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.372345  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2593  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0365897  normal  0.180328 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1782  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 
276 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.381283  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1677  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 
276 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.128581  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1731  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.867101  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1523  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.193632  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1495  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00542237  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  37.97 
 
 
347 aa  45.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1641  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1816  transcriptional regulator, MerR family  37.5 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.228936 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1708  transcriptional regulator, MerR family  30.21 
 
 
276 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1485  MerR family transcriptional regulator  30.21 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0543962  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
281 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1241  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
144 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3506  transcription activator, effector binding  31.76 
 
 
274 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771694  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0230  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1973  MerR family transcriptional regulator  32.48 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2039  MerR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
306 aa  44.3  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00422777  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  24.37 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  36.36 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1609  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
272 aa  43.5  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.822901  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1215  transcriptional regulator, MerR family  27.47 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2528  transcriptional regulator, MerR family  35.94 
 
 
293 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>