More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1655 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 
237 aa  490  9.999999999999999e-139  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1972  MerR family transcriptional regulator  54.2 
 
 
238 aa  262  3e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  40.08 
 
 
244 aa  191  7e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5071  putative transcriptional activator tipA  41.15 
 
 
243 aa  165  5e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4678  transcriptional activator  41.15 
 
 
243 aa  164  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4836  transcriptional activator tipA  40.74 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5200  transcriptional activator tipA  40.74 
 
 
243 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4694  transcriptional activator  41.15 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5109  putative transcriptional activator tipA  40.16 
 
 
243 aa  163  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00019726  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0129  putative transcriptional activator tipA  40.74 
 
 
244 aa  162  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.634344  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5111  putative transcriptional activator tipA  40.74 
 
 
244 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.252328  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5104  transcriptional activator tipA, putative  40.16 
 
 
243 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4791  MerR family transcriptional regulator  40.66 
 
 
241 aa  159  4e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  36 
 
 
249 aa  156  3e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3564  MerR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
245 aa  152  4e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0420  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
258 aa  148  7e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  32.79 
 
 
253 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2100  transcriptional regulator, MerR family  40.14 
 
 
284 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.444835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0264  MerR family transcriptional regulator  33.06 
 
 
250 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  29.1 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  32.92 
 
 
245 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0276  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
288 aa  112  5e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000161709  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  28.63 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0969  MerR family transcriptional regulator  29.1 
 
 
252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00256708  hitchhiker  0.0060004 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23430  predicted transcriptional regulator  30.08 
 
 
271 aa  108  7.000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0376314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.1 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  28.89 
 
 
254 aa  107  2e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  29.88 
 
 
259 aa  106  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
254 aa  106  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1079  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  30.24 
 
 
252 aa  105  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.23199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  27.35 
 
 
253 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  28.8 
 
 
254 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3432  TipAS antibiotic-recognition domain protein  29.64 
 
 
262 aa  102  5e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.712968  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1008  MerR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
253 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1781  transcriptional regulator, MerR family  30.89 
 
 
254 aa  102  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5434  MerR family transcriptional regulator  27.95 
 
 
251 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.736735  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0464  transcriptional regulator, MerR family  29.32 
 
 
254 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5055  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
251 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.561645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5143  MerR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
251 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  28 
 
 
268 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  28.63 
 
 
254 aa  97.1  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34160  predicted transcriptional regulator  26.55 
 
 
278 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0088  hypothetical protein  30.77 
 
 
253 aa  96.3  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3675  MerR family transcriptional regulator  26.85 
 
 
270 aa  95.9  6e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325472  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0148  MerR family transcriptional regulator  27.89 
 
 
257 aa  95.1  8e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.290112  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  30.68 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1411  hypothetical protein  53.25 
 
 
250 aa  93.6  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1582  hypothetical protein  46.3 
 
 
249 aa  92.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24960  predicted transcriptional regulator  25.21 
 
 
270 aa  91.7  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2309  MerR family transcriptional regulator  27.94 
 
 
258 aa  91.3  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.535608  normal  0.356789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0065  transcriptional regulator, MerR family  30.6 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  27.43 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  27.43 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4698  transcriptional regulator, MerR family  26.45 
 
 
253 aa  87  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  25 
 
 
274 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1098  MerR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.49269  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2824  transcriptional regulator, MerR family  57.75 
 
 
251 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00132895  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0639  transcriptional regulator, MerR family  26.61 
 
 
261 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3285  transcriptional regulator, MerR family  25.54 
 
 
272 aa  81.6  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  25.68 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0217  transcriptional regulator, MerR family  26.27 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2739  MerR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2183  putative transcriptional regulator, MerR family  26.43 
 
 
242 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1962  transcriptional regulator, MerR family  40.21 
 
 
250 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1413  hypothetical protein  40.2 
 
 
315 aa  72.4  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  38.61 
 
 
253 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5289  transcriptional regulator, MerR family  38.61 
 
 
251 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
254 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
253 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0323  transcription regulator family  48.48 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3346  transcriptional regulator, MerR family  36.05 
 
 
252 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00536383  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0073  hypothetical protein  43.24 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0572864  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1581  hypothetical protein  39.22 
 
 
315 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 
253 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
253 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3712  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
251 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2797  MerR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0275  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
107 aa  68.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.524855  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1287  MerR family transcriptional regulator  34.95 
 
 
250 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.917745  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2840  MerR family transcriptional regulator  34.17 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3016  MerR family transcriptional regulator  34.88 
 
 
252 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1070  transcriptional regulator, MerR family  35.58 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.01274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4916  multidrug-efflux transporter 1 regulator  50.85 
 
 
64 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0129  hypothetical protein  49.23 
 
 
347 aa  65.1  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.257512  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0331  MerR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
281 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
429 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3304  MCP methyltransferase, CheR-type  40.2 
 
 
398 aa  64.7  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
377 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1664  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 
225 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3493  transcriptional regulator, MerR family  27.69 
 
 
273 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3609  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 
288 aa  63.2  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.279155  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1739  MerR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
141 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.784519 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0668  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
272 aa  62.8  0.000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000812117  hitchhiker  0.0000325432 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  36.9 
 
 
342 aa  62.8  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2992  transcriptional regulator, MerR family  37.86 
 
 
282 aa  62.8  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.663692  normal  0.0173107 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1866  transcriptional regulator  31.25 
 
 
247 aa  62.4  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000190425  hitchhiker  0.000000000849298 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>