106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4208 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4208  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 258 aa  512  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  66.27 
 
 		 258 aa  335  3.9999999999999995e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.251701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0336  Methyltransferase type 11  52.38 
 
 		 259 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0390472  normal  0.038594 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0837  Methyltransferase type 11  46.31 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.702425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 377 aa  176  5e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1012  methyltransferase type 11  45.31 
 
 		 429 aa  165  9e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.878034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3108  Methyltransferase type 11  46.37 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.529003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0455  methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4070  MerR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.487071  normal  0.354959 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  42 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2361  methyltransferase type 11  56.36 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0504616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  42.22 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1705  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2301  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5564  methyltransferase type 11  66.67 
 
 		 258 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.917981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  23.21 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0249  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 260 aa  52.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0220437  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  39.33 
 
 		 261 aa  52.4  0.000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1633  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0213004 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.17 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.17 
 
 		 256 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.3 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.3 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  38.37 
 
 		 255 aa  49.7  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0774  Methyltransferase type 11  36.72 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0623  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  36.72 
 
 		 254 aa  49.7  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2729  SAM-dependent methyltransferase  35 
 
 		 264 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.88464  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3930  Methyltransferase type 11  61.11 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.56855 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  28.24 
 
 		 256 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4043  Methyltransferase type 11  61.11 
 
 		 250 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 206 aa  49.3  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.67 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0336  methyltransferase type 11  58.97 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.549644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  38.38 
 
 		 253 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.59 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 259 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  38.68 
 
 		 206 aa  47.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  38.2 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  38.83 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23770  putative biotin synthesis protein  50 
 
 		 187 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0761957 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4752  methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.302185  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3398  Methyltransferase type 11  42.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.08 
 
 		 254 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3543  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 261 aa  46.2  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00203  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  42.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4035  methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 203 aa  46.2  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.237399  normal  0.211519 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00208  hypothetical protein  42.62 
 
 		 207 aa  46.2  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  27.13 
 
 		 248 aa  45.8  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  39.13 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.76 
 
 		 230 aa  45.8  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0587  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.846793  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0777  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.621905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 236 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.19 
 
 		 250 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0301  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.5 
 
 		 257 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 197 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  39.53 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 254 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1008  methyltransferase type 11  51.35 
 
 		 256 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 251 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2710  demethylmenaquinone methyltransferase  29.31 
 
 		 243 aa  44.3  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  35 
 
 		 250 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  39.08 
 
 		 178 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4235  methyltransferase type 11  28.26 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0933321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  35.9 
 
 		 204 aa  44.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3455  methyltransferase type 11  50 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.915003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  35 
 
 		 250 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0206  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  40.98 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.57 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.57 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.57 
 
 		 256 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.11 
 
 		 231 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.197938  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.66 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  35.96 
 
 		 206 aa  43.9  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3263  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 248 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 250 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1124  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 209 aa  43.5  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000131299  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.57 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  34.11 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5837  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 206 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.735155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0360  methyltransferase type 11  35.34 
 
 		 275 aa  43.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.67 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 266 aa  43.5  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3145  hypothetical protein  45.95 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.725921  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3296  hypothetical protein  45.95 
 
 		 212 aa  43.1  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.114197  normal  0.0687983 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  34.19 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 188 aa  43.5  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 194 aa  43.1  0.005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3284  methyltransferase type 11  45.95 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.859694  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.65 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 219 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  34 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.22 
 
 		 209 aa  42.7  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  34 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  34 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>