More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1091 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  100 
 
 
206 aa  419  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  55.61 
 
 
208 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  51.49 
 
 
201 aa  199  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  43.48 
 
 
209 aa  187  9e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
205 aa  182  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
203 aa  177  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  45.81 
 
 
206 aa  177  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  46.53 
 
 
204 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.59 
 
 
206 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  44.83 
 
 
203 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  47.52 
 
 
202 aa  165  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
208 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
204 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
204 aa  159  3e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
216 aa  159  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  40.78 
 
 
207 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  42.16 
 
 
216 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  41.18 
 
 
203 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  39.51 
 
 
206 aa  145  5e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  42.79 
 
 
217 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  37.43 
 
 
187 aa  144  7.0000000000000006e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  37.13 
 
 
210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
213 aa  122  5e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  37.22 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
239 aa  96.7  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  37.16 
 
 
193 aa  92  6e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.81 
 
 
209 aa  90.1  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  40.52 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  34.22 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
188 aa  88.6  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
221 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  39.86 
 
 
213 aa  88.2  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  39.31 
 
 
225 aa  87.4  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  33.12 
 
 
212 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  34.57 
 
 
213 aa  84.7  8e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 
228 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  35.76 
 
 
181 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.54 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
223 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.12 
 
 
213 aa  80.9  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  36.67 
 
 
236 aa  81.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  34.25 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  30.65 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3273  hypothetical protein  56.25 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000980907  hitchhiker  0.000172386 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.51 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 
206 aa  77.4  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.49 
 
 
208 aa  77.4  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  30.05 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  30.05 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31180  predicted protein  40.86 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0286845  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  29.51 
 
 
210 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  31.35 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.65 
 
 
210 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  31.72 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 
195 aa  72  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  32.9 
 
 
228 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  28.19 
 
 
260 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50235  predicted protein  39.8 
 
 
292 aa  68.6  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.89 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.72 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31900  predicted protein  25.29 
 
 
298 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.041967  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  26.84 
 
 
200 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2102  Methyltransferase type 11  40.46 
 
 
157 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000102773  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.15 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6644  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
272 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 
189 aa  62.8  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
217 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.77 
 
 
229 aa  61.6  0.000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
215 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  25.16 
 
 
207 aa  58.9  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  29.09 
 
 
279 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  23.38 
 
 
207 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5117  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.3 
 
 
217 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.013812  hitchhiker  0.00397391 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4097  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.15 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.116223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4465  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.15 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.174082  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  34.96 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0651  methyltransferase  28.7 
 
 
131 aa  57  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.429029  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.69 
 
 
213 aa  57  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  29.55 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  27.91 
 
 
212 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  29.69 
 
 
237 aa  56.2  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4578  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.15 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.30493  normal  0.829265 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1589  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01203  conserved hypothetical protein  35 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  23.24 
 
 
255 aa  55.8  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  42.06 
 
 
254 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
269 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
254 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4780  methyltransferase type 11  25.64 
 
 
256 aa  55.1  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0464151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.71 
 
 
503 aa  55.1  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1911  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
266 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.257162  hitchhiker  0.000127679 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>