More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_53910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  100 
 
 
216 aa  435  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  93.6 
 
 
203 aa  387  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  70.3 
 
 
203 aa  295  5e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  52.2 
 
 
207 aa  211  9e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  48.04 
 
 
205 aa  207  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  51.74 
 
 
217 aa  191  6e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  49.75 
 
 
206 aa  189  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  46.31 
 
 
209 aa  187  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  46.46 
 
 
210 aa  183  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  48.78 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  48.02 
 
 
204 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  48.02 
 
 
204 aa  177  9e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  43.78 
 
 
208 aa  161  6e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  40.33 
 
 
187 aa  154  7e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 
206 aa  153  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
208 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  42.08 
 
 
201 aa  145  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  37.93 
 
 
203 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  41.58 
 
 
204 aa  140  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.2 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  39.22 
 
 
206 aa  139  3e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
202 aa  127  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  39.74 
 
 
213 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  37.77 
 
 
212 aa  106  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
221 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  38.69 
 
 
229 aa  94  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  36.99 
 
 
210 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  32.97 
 
 
223 aa  91.7  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  40.46 
 
 
193 aa  91.3  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.05 
 
 
213 aa  90.1  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  33.99 
 
 
216 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.98 
 
 
209 aa  87.4  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  33.51 
 
 
219 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  38.29 
 
 
201 aa  86.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  38.76 
 
 
211 aa  85.1  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.67 
 
 
208 aa  85.5  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  34.97 
 
 
209 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.81 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.48 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.71 
 
 
201 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  34.76 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  30.46 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
213 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  33.13 
 
 
239 aa  82.8  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  34.15 
 
 
236 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  33.52 
 
 
200 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31900  predicted protein  31.25 
 
 
298 aa  82.4  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.041967  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  34.45 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.5 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  33.96 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  36.49 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  36.49 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
209 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  37.01 
 
 
228 aa  77.4  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  35.76 
 
 
188 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
228 aa  76.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  35.81 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  38.65 
 
 
181 aa  75.1  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.71 
 
 
212 aa  74.3  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
206 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  28.65 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.82 
 
 
204 aa  72.4  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.08 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2376  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.33 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.282292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0721  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.33 
 
 
204 aa  71.6  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.635481  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.87 
 
 
213 aa  71.2  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.33 
 
 
204 aa  70.9  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  35.16 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  30.19 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2712  putative phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.31 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.870029  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50235  predicted protein  33.52 
 
 
292 aa  68.2  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  32.75 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  34.03 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01203  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07758  conserved hypothetical protein  31.55 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171876 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31180  predicted protein  34.44 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0286845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  30.92 
 
 
218 aa  64.7  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
228 aa  63.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2102  Methyltransferase type 11  40.94 
 
 
157 aa  63.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000102773  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.41 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.02 
 
 
223 aa  62.4  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.79 
 
 
216 aa  62  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.12 
 
 
229 aa  61.6  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.82 
 
 
212 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.79 
 
 
212 aa  60.1  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.06 
 
 
229 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  25.48 
 
 
255 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.53 
 
 
245 aa  59.7  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1629  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 
218 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.615509  normal  0.918656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.67 
 
 
211 aa  58.9  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  28.9 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
215 aa  58.2  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.82 
 
 
212 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0403  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.78 
 
 
214 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306332  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6066  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.451332  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  24.71 
 
 
279 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4492  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.73 
 
 
218 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.79 
 
 
259 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>