More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5685 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  100 
 
 
204 aa  417  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  50.5 
 
 
206 aa  194  8.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  50 
 
 
203 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  47.78 
 
 
205 aa  182  3e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  49.01 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  44.33 
 
 
209 aa  180  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  48.02 
 
 
216 aa  177  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  48.53 
 
 
204 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  44.83 
 
 
206 aa  175  4e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  47.26 
 
 
201 aa  167  7e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  46.04 
 
 
202 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  43.35 
 
 
216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  49.5 
 
 
217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  38.92 
 
 
203 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 
206 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  44.16 
 
 
208 aa  155  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  44.28 
 
 
207 aa  155  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  44.62 
 
 
210 aa  150  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
208 aa  150  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.11 
 
 
206 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  40.88 
 
 
187 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  40.36 
 
 
213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
193 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  40.51 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  42.26 
 
 
213 aa  111  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.64 
 
 
201 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.64 
 
 
201 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 
221 aa  103  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  38.96 
 
 
212 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  35.96 
 
 
201 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.13 
 
 
199 aa  101  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  38.07 
 
 
211 aa  101  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  38.06 
 
 
181 aa  100  1e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  37.74 
 
 
229 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  40 
 
 
239 aa  99.8  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 
213 aa  99.4  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
223 aa  97.8  9e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  38.61 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
220 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.85 
 
 
213 aa  95.5  5e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
228 aa  94.7  9e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  40.76 
 
 
188 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.32 
 
 
209 aa  94.4  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 
209 aa  92.8  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
210 aa  91.7  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  33.96 
 
 
200 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
221 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  42.65 
 
 
210 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  34.87 
 
 
219 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  35.39 
 
 
209 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
225 aa  87  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.89 
 
 
204 aa  85.1  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  30.63 
 
 
236 aa  84.7  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 
195 aa  84  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
209 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
228 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31900  predicted protein  28.81 
 
 
298 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.041967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  35.63 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  35.63 
 
 
210 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.19 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  39.68 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  33.16 
 
 
216 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  36.78 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31180  predicted protein  35.14 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0286845  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  30.49 
 
 
279 aa  73.9  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  40.82 
 
 
223 aa  73.2  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01203  conserved hypothetical protein  31.21 
 
 
232 aa  73.2  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.23 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  30.97 
 
 
260 aa  72  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.19 
 
 
255 aa  71.6  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2102  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 
157 aa  70.9  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000102773  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50235  predicted protein  31.07 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  30.16 
 
 
207 aa  69.7  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  30.95 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  27.27 
 
 
449 aa  69.7  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.45 
 
 
212 aa  69.7  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.65 
 
 
229 aa  68.6  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.24 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0321  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  39.32 
 
 
245 aa  68.6  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.943946  normal  0.235665 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2336  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
250 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.223131 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1939  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.41 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.64 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.9 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.55 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  38.38 
 
 
206 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.62 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.63 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0867  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.873465  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2739  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase, putative  33.58 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2360  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.175254  hitchhiker  0.000000000902529 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.57 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.64 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.64 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.06 
 
 
252 aa  65.1  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.58 
 
 
229 aa  65.1  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>