More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1427 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  100 
 
 
220 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  58.74 
 
 
229 aa  220  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  51.96 
 
 
219 aa  180  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  47.83 
 
 
213 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  43.32 
 
 
213 aa  134  8e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  44.5 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  44.5 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  44.98 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  44.93 
 
 
210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  45.85 
 
 
216 aa  129  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  44.71 
 
 
209 aa  123  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 
206 aa  119  3e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  41.44 
 
 
219 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.57 
 
 
206 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  44.51 
 
 
202 aa  112  6e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
208 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  42.93 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  35.62 
 
 
228 aa  111  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  38.39 
 
 
239 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
209 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  38.65 
 
 
206 aa  107  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.29 
 
 
209 aa  107  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  41.46 
 
 
204 aa  106  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  41.86 
 
 
188 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  43.98 
 
 
206 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  40.22 
 
 
221 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  37.57 
 
 
204 aa  102  3e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  33.55 
 
 
187 aa  102  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  39.45 
 
 
228 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.03 
 
 
199 aa  101  7e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  40.54 
 
 
217 aa  100  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  38.59 
 
 
221 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  30.18 
 
 
203 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  39.13 
 
 
210 aa  97.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  36.51 
 
 
213 aa  97.4  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
208 aa  97.1  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  42.94 
 
 
201 aa  96.7  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
223 aa  95.5  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
205 aa  94.4  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  34.13 
 
 
221 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  38.12 
 
 
203 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
216 aa  92.8  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  39.55 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  34.07 
 
 
212 aa  85.9  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
209 aa  85.1  8e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
207 aa  81.6  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.05 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  39.38 
 
 
193 aa  81.3  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  34.07 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  35.16 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.71 
 
 
201 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.71 
 
 
201 aa  78.6  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.71 
 
 
201 aa  77.4  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  39.87 
 
 
181 aa  76.6  0.0000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  36.69 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  35.05 
 
 
209 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  30.05 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  35.85 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  46.22 
 
 
223 aa  68.6  0.00000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.48 
 
 
212 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.81 
 
 
204 aa  67  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  27.88 
 
 
260 aa  67  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4073  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  31.76 
 
 
200 aa  65.9  0.0000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  32.47 
 
 
307 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0208  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.08 
 
 
250 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0448386  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  42.57 
 
 
255 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  37.25 
 
 
210 aa  62.4  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.89 
 
 
243 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
242 aa  62  0.000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 
251 aa  62  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  35.34 
 
 
241 aa  62  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2102  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 
157 aa  61.6  0.000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000102773  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 
244 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  37.14 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0059  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.624064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  37.84 
 
 
271 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.38 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
178 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4221  Methyltransferase type 11  38.66 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  28.18 
 
 
449 aa  59.3  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.29 
 
 
258 aa  58.9  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  35.78 
 
 
242 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0463  methyltransferase type 11  41.75 
 
 
197 aa  58.5  0.00000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.115014  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0328  Methyltransferase type 11  41.44 
 
 
259 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.28 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10334  hypothetical protein  35.82 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.672272 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  37.69 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1026  methyltransferase type 11  41.35 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.735672  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2472  methyltransferase type 11  36 
 
 
367 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.42 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1936  methyltransferase type 11  33.13 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0227883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>