More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0933 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  100 
 
 		 223 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  45.21 
 
 		 217 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  39.2 
 
 		 209 aa  122  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  39.89 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  38.29 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  36.71 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 206 aa  111  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  36.6 
 
 		 279 aa  110  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  38.59 
 
 		 193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 201 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  37.56 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.36 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 209 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  38.55 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  38.55 
 
 		 210 aa  105  7e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 210 aa  104  8e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  41.21 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  36.02 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 229 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  38.42 
 
 		 210 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  37.36 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  35.84 
 
 		 203 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 211 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  32.79 
 
 		 187 aa  101  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  32.98 
 
 		 203 aa  99.4  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 188 aa  99.4  4e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  31.49 
 
 		 205 aa  99  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  36.16 
 
 		 236 aa  99  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 		 204 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.55 
 
 		 206 aa  95.5  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  38.65 
 
 		 216 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 208 aa  94.4  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 204 aa  93.6  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  34.59 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  31.76 
 
 		 210 aa  93.2  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  32.97 
 
 		 216 aa  91.7  9e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 221 aa  91.3  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  35.87 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  36.07 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 220 aa  88.6  8e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  35.98 
 
 		 201 aa  88.6  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 208 aa  87.8  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  34.32 
 
 		 207 aa  86.7  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.32 
 
 		 199 aa  85.9  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 221 aa  84.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 206 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.36 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.9 
 
 		 204 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  30.48 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0604  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.36 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.977459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0696  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.17 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  30.73 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  31.32 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.42 
 
 		 229 aa  68.6  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  37.82 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1882  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.66 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  33.09 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07758  conserved hypothetical protein  29.94 
 
 		 334 aa  67  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171876 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  33.33 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  29.17 
 
 		 260 aa  67.4  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.21 
 
 		 225 aa  67  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1497  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.46 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4115  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.46 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  35.46 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.78 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.26 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.26 
 
 		 251 aa  65.1  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0403  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.26 
 
 		 214 aa  65.1  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0306332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.14 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  33.61 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0492  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  37.38 
 
 		 232 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4809  Methyltransferase type 11  34.48 
 
 		 229 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.483616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.33 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.31 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0730  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.78 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3086  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  31.93 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1815  Methyltransferase type 11  30.47 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.174113  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3961  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.04 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  33.69 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  34.58 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2440  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  34.4 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.330514 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  31.54 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3065  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.627483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  32.41 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.19 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>