More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6235 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  84.16 
 
 		 202 aa  330  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1826  Methyltransferase type 11  52.48 
 
 		 201 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00341289  normal  0.127097 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2526  methyltransferase type 11  46.57 
 
 		 205 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981998 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2642  methyltransferase type 11  51.47 
 
 		 208 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  48.53 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  48.53 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2552  methyltransferase type 11  47.55 
 
 		 206 aa  176  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  46.6 
 
 		 206 aa  175  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2834  Methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0713675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1091  Methyltransferase type 11  46.53 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.192231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2605  UbiE/COQ5 methyltransferase  40.29 
 
 		 206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0775549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1462  methyltransferase type 11  43.41 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1708  methyltransferase type 11  40.88 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0694395  normal  0.27386 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3814  methyltransferase type 11  44.33 
 
 		 203 aa  154  6e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0932  putative methyltransferase  44.33 
 
 		 217 aa  153  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53910  phospholipid methyltransferase  41.58 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.260165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4720  phospholipid methyltransferase  40.59 
 
 		 203 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.665331  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4481  methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.980043  normal  0.396448 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1854  methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 207 aa  126  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.823258 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2621  Methyltransferase type 11  41.48 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0146  methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 208 aa  114  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.844636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2319  generic methyltransferase  39.78 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.897419  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  39.26 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0442  hypothetical protein  39.43 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0196  methyltransferase type 11  43.12 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  38.79 
 
 		 239 aa  101  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02290  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.39 
 
 		 209 aa  98.2  8e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  41.46 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0008  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.71 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.257422  normal  0.214675 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  40.25 
 
 		 225 aa  95.5  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  43.05 
 
 		 201 aa  94.7  7e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  43.05 
 
 		 201 aa  95.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1015  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.371605  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2063  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 188 aa  92.8  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.571363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  42.38 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2883  methyltransferase type 11  39.11 
 
 		 221 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0898399  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1797  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 211 aa  92  5e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424011  hitchhiker  0.000214438 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2971  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 221 aa  90.5  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3076  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.851189  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1962  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 209 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.113355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43205  predicted protein  36.16 
 
 		 181 aa  89.4  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000000000040449  normal  0.10617 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3927  methyltransferase type 11  40.48 
 
 		 228 aa  88.6  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.852956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2195  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  33.33 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_6947  predicted protein  35.06 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0227815  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3689  Methyltransferase type 11  45.61 
 
 		 195 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2807  Methyltransferase type 11  34.32 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1079  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.233586  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4063  methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4138  methyltransferase type 12  34.15 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.950968 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2948  methyltransferase type 11  36.31 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.160502  normal  0.130465 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1565  Methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0848447  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4292  methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 210 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.401228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5114  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.947305 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  32.34 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0122  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  38.34 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.418924  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2133  methyltransferase type 12  35.67 
 
 		 210 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.153525  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11171  hypothetical protein  34.97 
 
 		 216 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4571  methyltransferase type 12  31.64 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156047 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1709  Methyltransferase type 11  41.42 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.171516 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1441  UbiE/COQ5 family methlytransferase  37.27 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.000764793  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0018  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  34.16 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000241496  hitchhiker  0.00000138707 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43931  predicted protein  28.57 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030953  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34078  predicted protein  26.95 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000133596  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2097  hypothetical protein  25.97 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2086  hypothetical protein  25.27 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2102  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000102773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  40.59 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0735  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.59 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.837751  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0914  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.21 
 
 		 255 aa  63.5  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3328  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.59 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31180  predicted protein  37.23 
 
 		 133 aa  63.2  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0286845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3485  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase / phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  35.46 
 
 		 197 aa  62  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.171708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3488  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.299223 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4560  Methyltransferase type 11  40.2 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.605076 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  37.86 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3273  hypothetical protein  50 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000980907  hitchhiker  0.000172386 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  28.9 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0288  Methyltransferase type 11  25.15 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  33.11 
 
 		 279 aa  59.3  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4748  hypothetical protein  31.58 
 
 		 273 aa  58.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000104492 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0651  methyltransferase  26.98 
 
 		 131 aa  58.2  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.429029  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_31474  predicted protein  26.32 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.981787  normal  0.166066 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.35 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0988  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.28 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.387372  decreased coverage  0.00000591406 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  36.29 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01203  conserved hypothetical protein  28.92 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  33.66 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11556  methyltransferase  37.9 
 
 		 347 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01520  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.09 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.344551  normal  0.63979 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3259  methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 244 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  41.58 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  36.44 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.65 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11780  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.32 
 
 		 262 aa  56.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>