More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9140 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
243 aa  491  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3411  type 11 methyltransferase  67.67 
 
 
232 aa  323  2e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  63.79 
 
 
232 aa  288  8e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0472  methyltransferase type 11  63.04 
 
 
251 aa  271  7e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0607  Methyltransferase type 11  55.17 
 
 
232 aa  248  9e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0317201  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  53.99 
 
 
245 aa  199  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  48.4 
 
 
252 aa  199  3e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.77 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  37.74 
 
 
261 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  36.59 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  37.96 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1204  Methyltransferase type 11  41.94 
 
 
247 aa  68.6  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
259 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8065  Methyltransferase type 11  42.99 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.365468  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2133  methyltransferase type 11  36.89 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.917807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0559  methyltransferase type 11  38.58 
 
 
216 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.492379 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
204 aa  61.6  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0606  Methyltransferase type 11  41.84 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0138058  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  36.94 
 
 
255 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2692  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 
270 aa  59.7  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.79255  normal  0.0821355 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  37.37 
 
 
218 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
291 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2897  Methyltransferase type 11  24.18 
 
 
189 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.75 
 
 
232 aa  59.3  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
224 aa  59.3  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  35.58 
 
 
310 aa  59.3  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  39.8 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.19 
 
 
305 aa  58.9  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.39 
 
 
257 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  42.71 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3216  methyltransferase type 11  34.09 
 
 
275 aa  58.9  0.00000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0314  putative methyltransferase  24.2 
 
 
211 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3833  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
213 aa  58.5  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  36.7 
 
 
265 aa  58.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  32.06 
 
 
263 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
260 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
271 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
208 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2758  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000336599  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2160  methyltransferase type 11  37 
 
 
236 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.115714 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  23.15 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1654  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
173 aa  56.6  0.0000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.682174  hitchhiker  0.00196009 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  28.75 
 
 
629 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2196  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1645  methyltransferase type 11  32.5 
 
 
281 aa  56.6  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
319 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  32.04 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
262 aa  56.2  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
178 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01234  transcriptional regulator  27.88 
 
 
331 aa  55.8  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
257 aa  55.8  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6235  methyltransferase type 11  36.44 
 
 
204 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2627  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.25 
 
 
271 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.114685 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1145  Methyltransferase type 11  29.37 
 
 
208 aa  55.8  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2692  methyltransferase type 11  37.25 
 
 
206 aa  55.5  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.253841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1591  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 
229 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.06 
 
 
239 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1427  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00176149  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5792  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.53 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  37.07 
 
 
658 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  37.5 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
211 aa  55.1  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4620  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225989  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4122  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.16 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0055  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
1171 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.180545  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2418  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.224648 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6211  methyltransferase type 11  37 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.304536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  27.96 
 
 
246 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.78 
 
 
201 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  34.55 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  36.36 
 
 
229 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.23 
 
 
256 aa  54.3  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.41 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1232  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 
274 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1265  transcriptional regulator  33.33 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  29.13 
 
 
213 aa  53.9  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
324 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.68 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0626  methyltransferase type 11  33.02 
 
 
224 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00710227 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.54 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  39.62 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.3 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
269 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  24.81 
 
 
306 aa  53.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1306  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 
223 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1002  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2361  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
256 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.775693  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4218  methyltransferase type 11  31.75 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.38 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>