More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_09950 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  61.92 
 
 		 245 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  48.4 
 
 		 243 aa  199  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0472  methyltransferase type 11  51.94 
 
 		 251 aa  191  7e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4465  Methyltransferase type 11  51.21 
 
 		 232 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3411  type 11 methyltransferase  47.49 
 
 		 232 aa  188  8e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.50002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0607  Methyltransferase type 11  51.18 
 
 		 232 aa  185  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0317201  normal  0.0851417 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20830  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.29 
 
 		 242 aa  128  9.000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  41.51 
 
 		 261 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3135  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  33.73 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 		 257 aa  69.3  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.52 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.18 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  27.41 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 242 aa  65.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5097  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 260 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.3355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3440  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0391  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0437563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0080  SAM-dependent methyltransferase  33.12 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00112476  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  31.52 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.91 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 263 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  33.61 
 
 		 208 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2348  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0100199  normal  0.0140968 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  34.76 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.29 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.48 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.66 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.5 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.91 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  35 
 
 		 312 aa  62.4  0.000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  32.37 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0078  methyltransferase type 11  33.57 
 
 		 259 aa  62  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  33.14 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.92 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.92 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  32.84 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.92 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.48 
 
 		 202 aa  61.6  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.3 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  36.92 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.88 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1419  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.5 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  33.62 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  39 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2319  methyltransferase type 11  41.84 
 
 		 178 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.690206  normal  0.0712991 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  36.75 
 
 		 1005 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4965  hypothetical protein  32.9 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.51 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2086  methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0379374  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2069  methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0598804  normal  0.808495 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2132  methyltransferase type 11  43.88 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0115408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2368  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000109502  hitchhiker  0.000328016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 		 1002 aa  59.7  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0222  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.32 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.188409  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.95 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  31.67 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  33.54 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.91 
 
 		 503 aa  59.3  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.43 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  35.81 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 284 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2470  methyltransferase type 11  32.69 
 
 		 250 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.28485  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0345  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  38.83 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.935966  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  31.25 
 
 		 265 aa  58.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.83 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.53 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  38.53 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  32.24 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  22.47 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4140  putative methyltransferase  30.73 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00813352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0034  ArsR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0629975 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1526  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 207 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.164104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0632  type 11 methyltransferase  38.79 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.186651 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  31.89 
 
 		 250 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>