More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0211 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  100 
 
 
266 aa  528  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  87.92 
 
 
259 aa  419  1e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  54.17 
 
 
239 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  44.34 
 
 
244 aa  152  7e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  40.41 
 
 
246 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  40.41 
 
 
246 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  41.74 
 
 
246 aa  149  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.02 
 
 
243 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  39.26 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 
241 aa  139  4.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
250 aa  137  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  40.59 
 
 
236 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1428  Methyltransferase type 11  37.09 
 
 
233 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.258196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
237 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.54 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.54 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  36.21 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.32 
 
 
257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.35 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.91 
 
 
236 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.13 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.91 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.18 
 
 
234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  28.91 
 
 
238 aa  108  6e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0699  Methyltransferase type 11  39.3 
 
 
231 aa  105  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0634895  normal  0.912408 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  46.56 
 
 
291 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  27.31 
 
 
246 aa  84.7  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  34.81 
 
 
232 aa  84  0.000000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0533  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
243 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  29.26 
 
 
241 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4681  hypothetical protein  25.81 
 
 
243 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740312  hitchhiker  1.6173199999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.73 
 
 
241 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0687  hypothetical protein  25.33 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0656  hypothetical protein  25.35 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0241729  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  25.81 
 
 
243 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  25.81 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.12 
 
 
241 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
243 aa  74.7  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0529  methyltransferase  25.81 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  40.52 
 
 
319 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  25.81 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  25.81 
 
 
243 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  24.89 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
264 aa  72  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.55 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3197  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1136  hypothetical protein  28.44 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051609  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0236  hypothetical protein  28.44 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.325524  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2135  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.44 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.246446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1264  type 11 methyltransferase  38.36 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.086933  normal  0.147611 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  33.68 
 
 
260 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1978  putative methyltransferase UbiE  28.44 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1997  putative methyltransferase UbiE  28.44 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479905  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1576  hypothetical protein  28.44 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362024  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  39.29 
 
 
305 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  31.06 
 
 
270 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3678  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
245 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2377  hypothetical protein  29.28 
 
 
292 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3385  hypothetical protein  28.42 
 
 
251 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9140  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.96 
 
 
243 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2180  putative methyltransferase  31.25 
 
 
239 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  21.39 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2104  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0094319  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2631  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.04 
 
 
265 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0880  amidohydrolase  35.14 
 
 
629 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3033  hypothetical protein  30.64 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.274712  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  35.56 
 
 
303 aa  67  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
273 aa  67  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2034  hypothetical protein  30.7 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2164  hypothetical protein  30.7 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.883153  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2580  hypothetical protein  30.7 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  30.21 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.59 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0747  hypothetical protein  30.7 
 
 
242 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  25.67 
 
 
244 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3115  methyl transferase  30.7 
 
 
283 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3410  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.611266  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  42.34 
 
 
231 aa  65.9  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  31.38 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  31.38 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
243 aa  65.5  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  29.19 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  35.81 
 
 
308 aa  64.7  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3164  hypothetical protein  28.18 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0872868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09950  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.76 
 
 
252 aa  64.3  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.03 
 
 
273 aa  64.7  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3414  hypothetical protein  28.18 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  25.26 
 
 
214 aa  64.7  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  42 
 
 
262 aa  63.9  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3148  ubiE/COQ5 methyltransferase family protein  26.67 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000361441  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
362 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0973  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>