More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0800 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  100 
 
 		 308 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  53.75 
 
 		 308 aa  333  3e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  53.25 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  46.73 
 
 		 308 aa  246  3e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  42.95 
 
 		 329 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  42.52 
 
 		 303 aa  209  4e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  47.39 
 
 		 330 aa  207  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  47.21 
 
 		 312 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  41.75 
 
 		 331 aa  203  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  40.78 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  36.54 
 
 		 326 aa  186  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  38.98 
 
 		 311 aa  185  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  39.42 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  37.46 
 
 		 324 aa  176  6e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  37.58 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  37.45 
 
 		 447 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 456 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  36.22 
 
 		 276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  35.97 
 
 		 255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33.1 
 
 		 436 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.39 
 
 		 276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 		 444 aa  124  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  27.11 
 
 		 561 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  27.11 
 
 		 561 aa  119  9e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 417 aa  113  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  34.71 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  34.66 
 
 		 274 aa  109  6e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  33.88 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  28.52 
 
 		 436 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  28.72 
 
 		 436 aa  103  4e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  34.57 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  23.99 
 
 		 577 aa  95.9  7e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.25 
 
 		 577 aa  92.8  6e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  23.29 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  29.25 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  27.7 
 
 		 438 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  35.81 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 244 aa  63.5  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  38.58 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 239 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  38.78 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  24.55 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06010  biotin synthesis protein BioC  40 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.746653  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  33.96 
 
 		 325 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0603  putative biotin synthesis protein BioC  38.24 
 
 		 274 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.3 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 259 aa  58.9  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  39.6 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  30 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3137  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  30.7 
 
 		 558 aa  58.5  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.785759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 246 aa  57.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06540  putative biotin synthesis protein BioC  37.25 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 		 291 aa  57.4  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0497  biotin synthesis protein BioC  31.29 
 
 		 269 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.572424  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  31.58 
 
 		 268 aa  57  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5905  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.592244  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  41.05 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0919  chromosome segregation ATPase  33.62 
 
 		 646 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.446373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 252 aa  55.8  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  32.28 
 
 		 1635 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 244 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  37.5 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.7 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  35.71 
 
 		 258 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1159  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 260 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.255904  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 237 aa  54.3  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  30.97 
 
 		 221 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.69 
 
 		 243 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 310 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0498  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 281 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136717  hitchhiker  0.000028196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  31.72 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 219 aa  52.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3351  methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 257 aa  52.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  28.19 
 
 		 267 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0747  hypothetical protein  29.17 
 
 		 243 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000483257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  32.99 
 
 		 253 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 261 aa  52.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0585  hypothetical protein  27.34 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0529  methyltransferase  27.34 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  34.45 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0395  biotin biosynthesis protein BioC  35.94 
 
 		 272 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0883344  normal  0.752327 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0426  hypothetical protein  24.6 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0391  biotin biosynthesis protein BioC  35.16 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0619  hypothetical protein  27.34 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 267 aa  51.6  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0674  hypothetical protein  27.34 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30135e-22 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>