More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0529 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 444 aa  893    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  42.89 
 
 		 456 aa  349  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  35.61 
 
 		 436 aa  210  5e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  28.42 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  28.42 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  35.95 
 
 		 303 aa  150  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  24.15 
 
 		 577 aa  146  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 436 aa  144  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  23.69 
 
 		 577 aa  143  7e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  28.41 
 
 		 417 aa  140  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  34.64 
 
 		 308 aa  140  7e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  34.63 
 
 		 329 aa  139  8.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  28.64 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  33.04 
 
 		 326 aa  133  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  32.4 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  38.52 
 
 		 324 aa  126  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  35.02 
 
 		 255 aa  122  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  34.63 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  32.75 
 
 		 310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.43 
 
 		 274 aa  119  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  32.44 
 
 		 338 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  31.55 
 
 		 311 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  38.38 
 
 		 330 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  39.21 
 
 		 312 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  34.24 
 
 		 276 aa  116  7.999999999999999e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  31.16 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  32.25 
 
 		 331 aa  111  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  36.82 
 
 		 272 aa  110  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  40 
 
 		 308 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  31.6 
 
 		 331 aa  108  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  33.76 
 
 		 241 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  35.66 
 
 		 272 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  28.03 
 
 		 438 aa  104  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 447 aa  100  5e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.28 
 
 		 878 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.1 
 
 		 810 aa  99.8  9e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  33.73 
 
 		 456 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 833 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.33 
 
 		 875 aa  94  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 		 828 aa  92.4  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 828 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  29.62 
 
 		 311 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 833 aa  90.5  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  33.19 
 
 		 824 aa  90.1  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.68 
 
 		 789 aa  90.1  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 315 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 626 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  36.14 
 
 		 828 aa  89.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 614 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 626 aa  89  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  36.5 
 
 		 732 aa  89  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  34.48 
 
 		 614 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 614 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  34.48 
 
 		 614 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 927 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  32.64 
 
 		 754 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  30.59 
 
 		 626 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  32.12 
 
 		 754 aa  83.6  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 637 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  30.68 
 
 		 695 aa  82.4  0.00000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  34.66 
 
 		 639 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  34.29 
 
 		 636 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 718 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 611 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 602 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 632 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  26.2 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 598 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  28.89 
 
 		 1406 aa  77.4  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.87 
 
 		 622 aa  77.8  0.0000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 612 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 		 3145 aa  77.4  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 4489 aa  77.4  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 		 637 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  32.04 
 
 		 619 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24.72 
 
 		 358 aa  76.6  0.0000000000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 		 3560 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 620 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.37 
 
 		 764 aa  75.9  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 		 635 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  25.46 
 
 		 681 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 614 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30 
 
 		 620 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3163  TPR domain protein  29.73 
 
 		 700 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 503 aa  75.1  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  24.75 
 
 		 1737 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20571  SAM-binding motif-containing protein  30.56 
 
 		 780 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.183834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  27.91 
 
 		 676 aa  73.6  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 685 aa  73.6  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  29.75 
 
 		 560 aa  73.2  0.000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 505 aa  72.4  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  31.96 
 
 		 708 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 279 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  27.31 
 
 		 733 aa  72  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  27.75 
 
 		 1694 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  25.13 
 
 		 3035 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 1827 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 4079 aa  70.5  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1825  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.578572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>