88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0226 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 311 aa  618  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  86.17 
 
 		 310 aa  527  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  63.58 
 
 		 338 aa  367  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  59.37 
 
 		 326 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  47.87 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  38.98 
 
 		 308 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  37.79 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  36.02 
 
 		 329 aa  159  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  37.59 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  37.69 
 
 		 255 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  37.3 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  35.91 
 
 		 331 aa  150  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 311 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  36.09 
 
 		 276 aa  149  7e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  34.29 
 
 		 308 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  33.81 
 
 		 561 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  36.83 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  33.81 
 
 		 561 aa  144  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  40.45 
 
 		 312 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  39.84 
 
 		 241 aa  134  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  40.98 
 
 		 330 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  32.54 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  36.88 
 
 		 274 aa  125  7e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 436 aa  125  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  39.1 
 
 		 272 aa  124  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  28.32 
 
 		 577 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  27.62 
 
 		 577 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  37.97 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 		 444 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  31.76 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 447 aa  108  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  32.74 
 
 		 436 aa  98.6  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  30.77 
 
 		 456 aa  96.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  27.83 
 
 		 439 aa  95.9  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 417 aa  84.3  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 438 aa  82.8  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 		 251 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  24.3 
 
 		 356 aa  53.5  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  24.87 
 
 		 219 aa  53.5  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  23.91 
 
 		 358 aa  52  0.00001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 265 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  37.68 
 
 		 3145 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  23.71 
 
 		 210 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  40.32 
 
 		 564 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1469  Methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 200 aa  47  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  22.76 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  25.83 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.73 
 
 		 293 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  23.01 
 
 		 244 aa  45.8  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 543 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 208 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  26.84 
 
 		 191 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.67 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  35.34 
 
 		 258 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.58 
 
 		 237 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2735  hypothetical protein  27.97 
 
 		 210 aa  45.1  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0712  hypothetical protein  44.19 
 
 		 161 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4266  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.985163  normal  0.26538 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  25 
 
 		 251 aa  45.1  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0744  TPR repeat-containing protein  42.86 
 
 		 164 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2742  TPR repeat-containing protein  36.62 
 
 		 202 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 225 aa  43.9  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  38.57 
 
 		 268 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0339  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.698701  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.56 
 
 		 245 aa  43.9  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2864  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 201 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0640  TPR repeat-containing protein  40.82 
 
 		 160 aa  43.5  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.85 
 
 		 229 aa  43.5  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2969  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 202 aa  43.5  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.742122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3139  methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 244 aa  43.1  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.763715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 1121 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.27 
 
 		 229 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 252 aa  42.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  25.42 
 
 		 284 aa  42.7  0.008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  27.92 
 
 		 354 aa  42.7  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  24.17 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 311 aa  42.4  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  24.17 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  27.14 
 
 		 210 aa  42.4  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  24.17 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  24.17 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  24.17 
 
 		 251 aa  42.4  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>