More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0872 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 311 aa  603  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  60.19 
 
 		 308 aa  346  3e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  53.25 
 
 		 308 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  52 
 
 		 308 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  48.49 
 
 		 303 aa  242  6e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  45.48 
 
 		 329 aa  233  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  44.62 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  43.99 
 
 		 331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  48.04 
 
 		 330 aa  202  5e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  41.53 
 
 		 324 aa  195  8.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  45.6 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  38.71 
 
 		 326 aa  183  3e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  37.85 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  39.61 
 
 		 310 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  37.82 
 
 		 311 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  36.98 
 
 		 447 aa  135  7.000000000000001e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  34.51 
 
 		 276 aa  125  9e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  34.51 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  33.98 
 
 		 276 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  38.12 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.2 
 
 		 561 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.2 
 
 		 561 aa  116  3.9999999999999997e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  36.58 
 
 		 274 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 436 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  32.83 
 
 		 272 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 456 aa  97.1  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  32.83 
 
 		 272 aa  95.9  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  33.61 
 
 		 241 aa  95.9  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  29.61 
 
 		 436 aa  92.8  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  29.46 
 
 		 456 aa  90.9  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  28.25 
 
 		 417 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  29.5 
 
 		 439 aa  88.2  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  29.62 
 
 		 444 aa  86.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  25.2 
 
 		 577 aa  86.7  5e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  24.41 
 
 		 577 aa  83.2  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  22.35 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  33.81 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2088  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 258 aa  67  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2029  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.308683  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  25.73 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.4 
 
 		 276 aa  62  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 241 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 257 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0885  methyltransferase, putative  37 
 
 		 214 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.784579  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 246 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0864  methyltransferase type 12  34.85 
 
 		 204 aa  58.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000143474  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003041  hypothetical protein  26.29 
 
 		 210 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02845  hypothetical protein  25.79 
 
 		 219 aa  58.9  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2125  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.458145 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4364  ArsR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 327 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0368446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.6 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 225 aa  57.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  24.68 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1344  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 218 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0289  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  30.6 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.911114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.6 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.35 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  34.85 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.63 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_35256  trans-aconitate methyltransferase 2  34.23 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0249977  normal  0.183726 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  35.05 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0995  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.304036  normal  0.338682 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  30.6 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  34.31 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  37.17 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4920  transcriptional regulator, ArsR family  40.82 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.85 
 
 		 256 aa  56.2  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  40.21 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  34.31 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02611  methyltransferase in menaquinone/biotin biosynthesis  34.69 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1223  Methyltransferase type 12  35.92 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.902999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.03 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07904  conserved hypothetical protein  28.22 
 
 		 325 aa  55.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.414403  normal  0.323526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 342 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1674  methyltransferase type 11  39.55 
 
 		 293 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.414272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 275 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1321  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 269 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  32.8 
 
 		 229 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.61 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.29 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  34 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  28.12 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 330 aa  53.9  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  26.35 
 
 		 191 aa  54.3  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.96 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 		 226 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>