More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3559 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3559  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 331 aa  644    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.3256  normal  0.483567 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  95.77 
 
 		 331 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  83.28 
 
 		 329 aa  526  1e-148  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3693  methyltransferase type 11  59.13 
 
 		 315 aa  298  1e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  54.95 
 
 		 330 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  54.95 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0872  Methyltransferase type 11  44.62 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0115679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1075  methyltransferase type 12  44.52 
 
 		 303 aa  208  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.396268 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0749  tetratricopeptide TPR_2  44.34 
 
 		 308 aa  203  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.385476 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0800  hypothetical protein  41.31 
 
 		 308 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.215996  normal  0.0187888 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1472  methyltransferase type 12  42.72 
 
 		 308 aa  192  9e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0197  Methyltransferase type 12  39.01 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0030  methyltransferase type 12  38.96 
 
 		 324 aa  161  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0591  methyltransferase  37.96 
 
 		 326 aa  158  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0226  Methyltransferase type 12  36.11 
 
 		 311 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0157  methyltransferase type 12  38.32 
 
 		 338 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0701135  normal  0.868895 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0489  methyltransferase type 12  37.19 
 
 		 447 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2147  methyltransferase type 12  33.73 
 
 		 276 aa  120  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1028  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  119  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1063  hypothetical protein  32.94 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.051758  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  38.84 
 
 		 436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  33.56 
 
 		 456 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2294  Methyltransferase type 12  36.21 
 
 		 272 aa  109  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43435  predicted protein  30.53 
 
 		 456 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2061  Methyltransferase type 12  35.8 
 
 		 272 aa  105  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.878422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1594  methyltransferase type 12  35.22 
 
 		 274 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.501419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2059  hypothetical protein  34.71 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3443  methyltransferase type 12  31.98 
 
 		 436 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0605302 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  29.41 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.2 
 
 		 577 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  29.41 
 
 		 561 aa  101  2e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  30.2 
 
 		 577 aa  100  3e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2106  methyltransferase type 12  32.91 
 
 		 436 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3396  methyltransferase type 12  33.17 
 
 		 439 aa  99.8  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1472  methyltransferase type 12  30.67 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.773067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  30.42 
 
 		 444 aa  95.5  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  24.72 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2263  Methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 232 aa  71.2  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0543  hypothetical protein  30.06 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.395054  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  35.43 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  32.38 
 
 		 438 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  33.86 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  33.86 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  33.86 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.16 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03996  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0273649  normal  0.194457 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  33.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  33.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  33.07 
 
 		 251 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  30.21 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  36.76 
 
 		 251 aa  58.2  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  37.12 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  40.91 
 
 		 236 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0024  TPR repeat-containing protein  22.97 
 
 		 356 aa  57  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  40.95 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1891  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.742505  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0048  TPR domain-containing protein  22.31 
 
 		 356 aa  55.8  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.24301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  36.36 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  35.88 
 
 		 251 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  35.61 
 
 		 251 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  34.33 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  41.51 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  34.96 
 
 		 246 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 		 226 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 241 aa  53.5  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.39 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4085  biotin biosynthesis protein BioC  31.76 
 
 		 267 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 246 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  37.86 
 
 		 243 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0726  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.29 
 
 		 242 aa  53.1  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.643352  normal  0.179334 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  30.61 
 
 		 283 aa  53.1  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 		 291 aa  53.1  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  35.58 
 
 		 290 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.57 
 
 		 257 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  38.46 
 
 		 658 aa  52.8  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  41 
 
 		 273 aa  52.8  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3324  methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0150  hypothetical protein  37.14 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 246 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0772  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 209 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  43 
 
 		 252 aa  52.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4895  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 242 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00265389 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  37.39 
 
 		 244 aa  52.4  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1368  methyltransferase type 12  25.16 
 
 		 210 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0335  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  29.94 
 
 		 1001 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  39.42 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0274  hypothetical protein  33.33 
 
 		 290 aa  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.80045  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  39 
 
 		 213 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0358  methyltransferase type 11  31.95 
 
 		 362 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4185  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  51.2  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0341246  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0193  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.442693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 276 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  41.75 
 
 		 261 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>