More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1855 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  100 
 
 
232 aa  470  1.0000000000000001e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  54.59 
 
 
248 aa  275  4e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  40.64 
 
 
275 aa  205  4e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  33.05 
 
 
249 aa  154  9e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  33.05 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  33.05 
 
 
249 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  33.05 
 
 
249 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  32.63 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  32.63 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  32.63 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  32.63 
 
 
249 aa  151  8.999999999999999e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  33.05 
 
 
249 aa  150  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  32.63 
 
 
249 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  32.48 
 
 
247 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
249 aa  146  3e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  35.53 
 
 
247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  34.5 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  33.19 
 
 
245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 
247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.08 
 
 
244 aa  124  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.74 
 
 
266 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  29.46 
 
 
248 aa  119  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.51 
 
 
276 aa  115  6e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
260 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  32.76 
 
 
244 aa  112  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  32.02 
 
 
238 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  32.02 
 
 
238 aa  112  5e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.74 
 
 
269 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.02 
 
 
276 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  28.07 
 
 
239 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  29 
 
 
233 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 
254 aa  101  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  32.68 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  28.69 
 
 
246 aa  94.4  1e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
256 aa  93.2  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  28.76 
 
 
242 aa  92  6e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25 
 
 
259 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  28.07 
 
 
250 aa  89  5e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
246 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  22.65 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  26.01 
 
 
246 aa  85.1  8e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  22.12 
 
 
269 aa  85.1  9e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  24.48 
 
 
294 aa  84.3  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  26.49 
 
 
272 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  25.45 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
258 aa  78.6  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
249 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  24.38 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  30.22 
 
 
242 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.67 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
250 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  27.27 
 
 
239 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.61 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
285 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  26.29 
 
 
248 aa  68.9  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 
285 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
263 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
251 aa  67.8  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  31.71 
 
 
255 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
261 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  31.71 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  26.14 
 
 
152 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  23.5 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  30.89 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  24.06 
 
 
273 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  26.52 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  28.77 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.78 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.78 
 
 
262 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  29.7 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  29.7 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  31.5 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  26.86 
 
 
281 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  22.18 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  24.24 
 
 
237 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  27.52 
 
 
255 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  28.79 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  24.77 
 
 
251 aa  64.3  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  23.43 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  35.58 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.89 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  25.34 
 
 
261 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  35.58 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  23.81 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0127  methyltransferase type 11  35.58 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  24.02 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  27.52 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.89 
 
 
261 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  25 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  22.98 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>