More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4536 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  100 
 
 
259 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  64.34 
 
 
273 aa  292  5e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  48.47 
 
 
246 aa  186  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  38.89 
 
 
259 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  39.1 
 
 
269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.8 
 
 
266 aa  124  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
254 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  29.31 
 
 
248 aa  116  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
247 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
248 aa  103  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.67 
 
 
275 aa  99.8  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  27.38 
 
 
249 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
276 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.98 
 
 
249 aa  95.9  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
232 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.24 
 
 
247 aa  94  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  93.2  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.71 
 
 
276 aa  93.2  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.59 
 
 
249 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  92  9e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.59 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.59 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  26.59 
 
 
249 aa  90.5  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.87 
 
 
244 aa  90.9  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  25.94 
 
 
269 aa  90.5  3e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  34.86 
 
 
258 aa  89.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.79 
 
 
249 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  30.15 
 
 
233 aa  87.8  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.09 
 
 
239 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  27.35 
 
 
246 aa  81.6  0.00000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.75 
 
 
239 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25.27 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  31.58 
 
 
256 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.75 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.95 
 
 
296 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  35.24 
 
 
251 aa  78.2  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.19 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.36 
 
 
259 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  27.75 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  27.75 
 
 
237 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.43 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  24.55 
 
 
245 aa  72  0.000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  25.45 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  26.87 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  24.55 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 
248 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  27.09 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  27.04 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  25.35 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  25.35 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  29.52 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  31.3 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2561  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
261 aa  65.5  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.894983  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.73 
 
 
272 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
262 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30 
 
 
262 aa  64.3  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  36.28 
 
 
190 aa  64.7  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  34.69 
 
 
254 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
264 aa  63.5  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  26.34 
 
 
541 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  25.85 
 
 
541 aa  63.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  34.26 
 
 
663 aa  63.2  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  33.59 
 
 
638 aa  62.8  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
241 aa  63.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  26.34 
 
 
541 aa  63.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  28.86 
 
 
246 aa  62.8  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  39.81 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.04 
 
 
190 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  36.04 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.8 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  25.85 
 
 
541 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  34.43 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
258 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  25.37 
 
 
541 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1272  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3141  methyltransferase type 11  34.72 
 
 
269 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.988158 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
675 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  34.58 
 
 
637 aa  59.7  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
256 aa  59.7  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  59.7  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3235  methyltransferase type 12  35.5 
 
 
331 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.341201 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  30.56 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1440  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
248 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  33.04 
 
 
259 aa  58.9  0.00000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.19 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  44 
 
 
271 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.17 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1394  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
248 aa  58.5  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3370  methyltransferase type 11  34.62 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.335099  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>