More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0378 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  100 
 
 		 251 aa  522  1e-147  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 276 aa  103  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  37.64 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  33.04 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  37.08 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  37.08 
 
 		 237 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  36.11 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.28 
 
 		 266 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  35.96 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  32.17 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  32.29 
 
 		 237 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.83 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  35.37 
 
 		 248 aa  90.9  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 244 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 275 aa  87.8  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  37.32 
 
 		 231 aa  85.9  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  28.97 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.24 
 
 		 272 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  30.74 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  28.64 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  29.72 
 
 		 269 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.27 
 
 		 259 aa  72  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  27.96 
 
 		 248 aa  69.3  0.00000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  28.57 
 
 		 238 aa  69.3  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.46 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.46 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.46 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.13 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.01 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.01 
 
 		 249 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.34 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.34 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.56 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.53 
 
 		 269 aa  67.4  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.31 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  31.03 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  30.07 
 
 		 250 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.78 
 
 		 253 aa  62.8  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.51 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  27.17 
 
 		 247 aa  62  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  35.45 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.82 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  33.74 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  36.05 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.66 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 		 259 aa  59.7  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  30.48 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1305  Methyltransferase type 11  31.2 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  38.02 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2831  Methyltransferase type 11  32.23 
 
 		 235 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  27.93 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 247 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  30.06 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  36.36 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  36.13 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  24.36 
 
 		 246 aa  57  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  32.03 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 258 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  28.57 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  32.54 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  33.65 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  29.71 
 
 		 253 aa  55.1  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  29.52 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  24.23 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  26.77 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 263 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  24 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  27.05 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  29.81 
 
 		 261 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.66 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  27.05 
 
 		 262 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  30.47 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  28.04 
 
 		 285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.15 
 
 		 241 aa  54.3  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  25.49 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  24.54 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  27.05 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.23 
 
 		 250 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  27.05 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>