More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3418 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  100 
 
 
275 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  39.16 
 
 
248 aa  210  2e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  40.64 
 
 
232 aa  206  5e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  32.95 
 
 
249 aa  168  9e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  32.7 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  32.7 
 
 
249 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  32.58 
 
 
249 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  32.2 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  32.2 
 
 
249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  31.82 
 
 
249 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  31.82 
 
 
249 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  31.82 
 
 
249 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
249 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.56 
 
 
249 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  30.97 
 
 
247 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  34.3 
 
 
276 aa  136  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  29.7 
 
 
247 aa  124  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.95 
 
 
276 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  27.82 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  27.82 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  25.94 
 
 
239 aa  119  6e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  32.73 
 
 
260 aa  118  9e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  27.17 
 
 
247 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.15 
 
 
266 aa  112  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  28.2 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.84 
 
 
244 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.32 
 
 
244 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  28.25 
 
 
245 aa  103  3e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  30.74 
 
 
242 aa  102  5e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  32.2 
 
 
233 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.37 
 
 
254 aa  100  2e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  27.14 
 
 
245 aa  101  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  31.2 
 
 
294 aa  95.5  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.41 
 
 
269 aa  92  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.99 
 
 
258 aa  91.7  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  28.27 
 
 
251 aa  90.1  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  89.7  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  28.15 
 
 
272 aa  90.1  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  25.86 
 
 
246 aa  85.9  7e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  27.78 
 
 
237 aa  85.5  9e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  26.32 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
249 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  25.11 
 
 
248 aa  83.2  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  33.33 
 
 
239 aa  83.2  0.000000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  33.33 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  26.74 
 
 
237 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  26.91 
 
 
256 aa  82.4  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  34.27 
 
 
237 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  25.95 
 
 
261 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  27.53 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  25.87 
 
 
261 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.35 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  35.83 
 
 
231 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  22.81 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.77 
 
 
296 aa  75.1  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  25.3 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  25.67 
 
 
263 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  23.19 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  24.23 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 
246 aa  72.4  0.000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  23.57 
 
 
240 aa  71.6  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  26.34 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.53 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.9 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  25.31 
 
 
263 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.1 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.1 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.19 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.19 
 
 
261 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  26.53 
 
 
575 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  24.46 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  23.79 
 
 
261 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  26.85 
 
 
247 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.31 
 
 
220 aa  65.5  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  26.18 
 
 
247 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  23.68 
 
 
255 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
285 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  26.76 
 
 
250 aa  64.3  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  33.61 
 
 
315 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.11 
 
 
253 aa  63.9  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  23.43 
 
 
281 aa  63.9  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  28.19 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
285 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  28.19 
 
 
285 aa  63.5  0.000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  27.47 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  23.48 
 
 
247 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4832  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3334  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4181  methyltransferase type 11  26.14 
 
 
270 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.43 
 
 
241 aa  62.4  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  25.5 
 
 
264 aa  62  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  23.53 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>