More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1329 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  100 
 
 
250 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  72 
 
 
250 aa  392  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  72.84 
 
 
247 aa  383  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  69.67 
 
 
247 aa  380  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  71.19 
 
 
261 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  69.55 
 
 
247 aa  368  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  67.62 
 
 
260 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  68.02 
 
 
281 aa  364  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  67.62 
 
 
247 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  68.31 
 
 
247 aa  363  1e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  68.44 
 
 
249 aa  363  2e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  68.44 
 
 
247 aa  362  4e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  67.34 
 
 
255 aa  361  5.0000000000000005e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  62.84 
 
 
263 aa  346  2e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  63.32 
 
 
261 aa  345  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  62.84 
 
 
263 aa  344  7e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  62.93 
 
 
261 aa  341  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  57.95 
 
 
285 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  57.6 
 
 
285 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  57.6 
 
 
285 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  57.24 
 
 
285 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  45.27 
 
 
248 aa  220  9.999999999999999e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
247 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.58 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  32.52 
 
 
232 aa  72.4  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  23.48 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  21.68 
 
 
233 aa  70.1  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  38.54 
 
 
296 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
242 aa  65.9  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  29.66 
 
 
152 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
256 aa  65.1  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.61 
 
 
276 aa  63.9  0.000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25.37 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  31.09 
 
 
237 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.97 
 
 
227 aa  63.5  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  30.07 
 
 
251 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  33.7 
 
 
237 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
243 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
252 aa  62.8  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  32.14 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.97 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.54 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.63 
 
 
201 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.08 
 
 
269 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  26.01 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  25.79 
 
 
248 aa  59.7  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  29.5 
 
 
234 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  26.58 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  27.35 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.81 
 
 
249 aa  58.9  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.35 
 
 
237 aa  58.5  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.35 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
252 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  25.25 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
221 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.39 
 
 
264 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  33.65 
 
 
237 aa  57  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 
291 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.72 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
190 aa  56.2  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  29.2 
 
 
220 aa  56.2  0.0000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  31.78 
 
 
256 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  27.97 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  22.97 
 
 
247 aa  55.8  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.48 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  31.58 
 
 
246 aa  55.5  0.0000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  25 
 
 
269 aa  55.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  26.5 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  25.71 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
234 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  26.42 
 
 
231 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.98 
 
 
260 aa  54.7  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.75 
 
 
253 aa  53.9  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.09 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
305 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  27.41 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  31.18 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  30 
 
 
262 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
280 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
256 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1149  methyltransferase type 12  27.08 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  29.52 
 
 
261 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>