More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1158 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  498  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  60.25 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  60.25 
 
 		 238 aa  305  5.0000000000000004e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  36.48 
 
 		 276 aa  175  5e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  36.18 
 
 		 249 aa  172  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  35.77 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  36.33 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  36.33 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  36.33 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  36.33 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  36.33 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  35.92 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  35.77 
 
 		 249 aa  169  3e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  37.55 
 
 		 247 aa  169  4e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  36.99 
 
 		 269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  36.07 
 
 		 244 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  37.82 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  35.1 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  30.33 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  29.51 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  31.71 
 
 		 250 aa  119  3.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  25.94 
 
 		 275 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 247 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  30.8 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.07 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  30 
 
 		 245 aa  106  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  26.45 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  27.78 
 
 		 248 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.82 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 220 aa  92  6e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.23 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 		 240 aa  91.3  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.02 
 
 		 254 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  29.13 
 
 		 272 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 244 aa  85.1  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  23.58 
 
 		 260 aa  82  0.000000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.42 
 
 		 259 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  28.64 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  36.19 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  35.56 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.1 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.69 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  25.65 
 
 		 294 aa  78.6  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  31.05 
 
 		 231 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  26 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  31.1 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  28.07 
 
 		 237 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  32.85 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  34.45 
 
 		 237 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25.27 
 
 		 259 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  24.03 
 
 		 259 aa  70.1  0.00000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  22.93 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 259 aa  69.7  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  26.49 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 252 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  24.21 
 
 		 258 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 263 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  27.81 
 
 		 247 aa  67  0.0000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 285 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  22.08 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  23.76 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  29.1 
 
 		 261 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  24.39 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 		 248 aa  64.7  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 		 246 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  27.92 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 		 286 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.37 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 243 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  27.44 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  29.9 
 
 		 242 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  22.44 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  29.41 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  25.43 
 
 		 248 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  21.27 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  25.32 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  27.41 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  26.26 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  26.01 
 
 		 250 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  25.83 
 
 		 268 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  23.88 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>