218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_I1302 on replicon NC_011312
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  100 
 
 
247 aa  520  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  66.4 
 
 
247 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  67.62 
 
 
250 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  63.27 
 
 
255 aa  350  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  64.37 
 
 
260 aa  348  3e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  64.9 
 
 
250 aa  349  3e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  64.37 
 
 
247 aa  346  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  61.94 
 
 
261 aa  343  1e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  60.73 
 
 
247 aa  340  1e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  60.77 
 
 
261 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  60.31 
 
 
263 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  61.54 
 
 
247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  59.54 
 
 
263 aa  333  1e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  59.92 
 
 
249 aa  332  4e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  60.38 
 
 
261 aa  332  5e-90  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  62.7 
 
 
281 aa  332  5e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  60.32 
 
 
247 aa  323  2e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  53.87 
 
 
285 aa  320  9.999999999999999e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  53.52 
 
 
285 aa  318  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  53.52 
 
 
285 aa  317  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  53.17 
 
 
285 aa  316  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  42.74 
 
 
248 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.99 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
152 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  22.77 
 
 
233 aa  67.8  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  33.57 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.81 
 
 
239 aa  67  0.0000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
256 aa  67  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.77 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34.17 
 
 
296 aa  66.2  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.24 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  31.03 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
257 aa  63.9  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  30 
 
 
269 aa  63.2  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.52 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
256 aa  62.4  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  35.64 
 
 
272 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  28.26 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.09 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 
234 aa  60.8  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.24 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.95 
 
 
247 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  28.38 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.21 
 
 
249 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.95 
 
 
259 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.21 
 
 
249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  27.08 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  26.34 
 
 
256 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  30.94 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  23.26 
 
 
260 aa  56.6  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.9 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.9 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  29.17 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.9 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.9 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.9 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  30.94 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.12 
 
 
237 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  32.65 
 
 
201 aa  55.8  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  23.68 
 
 
241 aa  55.5  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.9 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25.52 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  24.4 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.28 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  25 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.52 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1679  methyltransferase type 11  27.97 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  25 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  25 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  24.82 
 
 
390 aa  54.3  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  34.65 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
269 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.08 
 
 
239 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.48 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.87 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.87 
 
 
238 aa  53.5  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.08 
 
 
237 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  27.37 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  27.37 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  25.14 
 
 
261 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  25 
 
 
262 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  26.52 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  25.9 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
240 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
246 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
220 aa  52.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.81 
 
 
234 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28.91 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>