51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2300 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 240 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  47.13 
 
 		 248 aa  222  4e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  43.55 
 
 		 270 aa  155  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 243 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  35 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.82 
 
 		 257 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  29.05 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  31.67 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  34.68 
 
 		 242 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  24.4 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  26.67 
 
 		 247 aa  52.4  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 242 aa  51.6  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  22.47 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  22.34 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  22.34 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  24.09 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  20 
 
 		 239 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  25 
 
 		 246 aa  49.7  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 252 aa  49.3  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  28.43 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  23.98 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 241 aa  48.9  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 235 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 246 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  23.38 
 
 		 263 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  27.94 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  29.52 
 
 		 235 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  34.07 
 
 		 254 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  23.08 
 
 		 263 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  33.33 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  19.52 
 
 		 248 aa  44.3  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  29.46 
 
 		 240 aa  43.9  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2832  methyl transferase  30.19 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.74875  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5173  biotin biosynthesis protein BioC  36.46 
 
 		 268 aa  43.5  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0205142  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.63 
 
 		 258 aa  43.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.14 
 
 		 283 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  20.74 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  23.7 
 
 		 285 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  24.44 
 
 		 281 aa  42.7  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  23.7 
 
 		 285 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  23.7 
 
 		 285 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  23.7 
 
 		 285 aa  42.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  24.8 
 
 		 262 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1974  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 260 aa  42  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00383386  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  33 
 
 		 267 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  33 
 
 		 267 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 239 aa  41.6  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.51 
 
 		 247 aa  42  0.01  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 268 aa  41.6  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>