162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4547 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  100 
 
 		 254 aa  521  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  61.97 
 
 		 246 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  54.51 
 
 		 254 aa  248  9e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  53.25 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  56.15 
 
 		 261 aa  222  4.9999999999999996e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  54.34 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  48.73 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  45.88 
 
 		 247 aa  186  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  35.77 
 
 		 249 aa  135  5e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  36.11 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  33.01 
 
 		 267 aa  106  4e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  31.66 
 
 		 262 aa  80.9  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.45 
 
 		 315 aa  78.2  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  31.84 
 
 		 237 aa  77.8  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  35.77 
 
 		 184 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  27.59 
 
 		 575 aa  72.8  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  27.12 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 248 aa  63.5  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  30.84 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  30.84 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  30.84 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  24.89 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  29.91 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  33.64 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  29.91 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.59 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  30.84 
 
 		 253 aa  59.3  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  34.23 
 
 		 258 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  35.85 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  29.63 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  36.79 
 
 		 238 aa  57.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  30.77 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  30.77 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  30.77 
 
 		 249 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  23.87 
 
 		 253 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  29.81 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  29.81 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  28.97 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.91 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  30.46 
 
 		 254 aa  55.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.73 
 
 		 249 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  20.63 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  24.67 
 
 		 263 aa  55.1  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  30.69 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  24.31 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  23.39 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  22.15 
 
 		 307 aa  53.5  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  25.7 
 
 		 249 aa  53.1  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.79 
 
 		 246 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  28.83 
 
 		 296 aa  52.4  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  28.97 
 
 		 253 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  27.09 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  29.73 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  30.18 
 
 		 304 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  22.02 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  36.25 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  28.26 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 269 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 244 aa  50.4  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  31.82 
 
 		 258 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  22.27 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 		 259 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  22.27 
 
 		 261 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 247 aa  49.3  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  17.79 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 276 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0872  methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 206 aa  48.9  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00554243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 247 aa  48.9  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.69 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 250 aa  48.1  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  22.02 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  28.85 
 
 		 252 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  22.02 
 
 		 262 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  34.26 
 
 		 249 aa  46.6  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  28.85 
 
 		 663 aa  46.6  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.09 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 262 aa  46.6  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  23.44 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  27.5 
 
 		 253 aa  45.8  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  30.88 
 
 		 268 aa  45.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 261 aa  46.2  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>