115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1418 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  100 
 
 
248 aa  519  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2300  Methyltransferase type 11  47.13 
 
 
240 aa  222  4e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 
249 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 
257 aa  76.6  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  34.96 
 
 
152 aa  72  0.000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  27.6 
 
 
243 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  25 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 
241 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.87 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.87 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 
286 aa  62.4  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 
254 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  21.91 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  21.27 
 
 
239 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.36 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 
260 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  27.78 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  27.78 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  32.67 
 
 
201 aa  57  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.06 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  28 
 
 
255 aa  55.8  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  33.03 
 
 
200 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  27.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  29.47 
 
 
267 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  27.27 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.79 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  25.12 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.88 
 
 
201 aa  53.1  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7221  putative 3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.65 
 
 
241 aa  52.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564815  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
207 aa  52  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.5 
 
 
249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  26.62 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3981  methyltransferase type 12  32.35 
 
 
235 aa  51.2  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.457714  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.5 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  21.79 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  29.81 
 
 
263 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  33.06 
 
 
252 aa  48.9  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  36.84 
 
 
202 aa  48.9  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.48 
 
 
266 aa  48.9  0.00008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
252 aa  48.5  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  26.98 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  27.56 
 
 
211 aa  48.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  36.59 
 
 
203 aa  48.5  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  28.28 
 
 
195 aa  47.8  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
276 aa  47.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  24.46 
 
 
250 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.02 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3106  generic methyltransferase  27.37 
 
 
311 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.33572  normal  0.0489041 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  20.35 
 
 
237 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  22.28 
 
 
233 aa  46.2  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  31.76 
 
 
247 aa  46.2  0.0005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0768  methyltransferase type 12  25.19 
 
 
222 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.215432 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  23.58 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.71 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.71 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  28.57 
 
 
239 aa  45.4  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  27.1 
 
 
256 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 
260 aa  45.8  0.0007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.16 
 
 
252 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.71 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  28.71 
 
 
252 aa  45.8  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2412  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 
240 aa  45.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.125357  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  27.46 
 
 
248 aa  45.4  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1273  methyltransferase small  27.19 
 
 
206 aa  45.4  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4045  Methyltransferase type 12  26.43 
 
 
249 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.741361 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.71 
 
 
243 aa  45.4  0.0009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.74 
 
 
248 aa  45.4  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  33.33 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4620  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
235 aa  44.7  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0418721  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
268 aa  44.7  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.47 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.71 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  21.29 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  31.9 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  28.72 
 
 
390 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.26 
 
 
251 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.1 
 
 
256 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0530  putative methylase  29.91 
 
 
269 aa  44.3  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
217 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.82 
 
 
258 aa  43.9  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.72 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.72 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2247  Methyltransferase type 11  30.39 
 
 
246 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.52 
 
 
257 aa  44.3  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  37.66 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1203  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
239 aa  44.3  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  32.77 
 
 
315 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  29.73 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  29.73 
 
 
269 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.82 
 
 
258 aa  43.9  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  26.02 
 
 
246 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>