More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0374 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  100 
 
 
245 aa  506  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  48.95 
 
 
254 aa  245  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  49.37 
 
 
243 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  47.35 
 
 
246 aa  240  1e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  43.67 
 
 
255 aa  215  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
246 aa  174  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 
262 aa  139  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  31.98 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  29.84 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  31.6 
 
 
259 aa  133  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
280 aa  131  7.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  29.67 
 
 
262 aa  122  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  30 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.79 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  30.36 
 
 
253 aa  95.1  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  29.06 
 
 
249 aa  89  6e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
249 aa  85.9  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  36.64 
 
 
304 aa  80.9  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.14 
 
 
250 aa  80.9  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  34.87 
 
 
252 aa  81.3  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  30.04 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  35.25 
 
 
248 aa  78.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
675 aa  77.8  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  29.09 
 
 
271 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.8 
 
 
253 aa  72  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  25.9 
 
 
257 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
256 aa  70.5  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.36 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  25.81 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.45 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
286 aa  69.7  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  35.51 
 
 
541 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  40 
 
 
663 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  26.69 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  42.45 
 
 
637 aa  68.2  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  35.51 
 
 
541 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
258 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  34.48 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  34.58 
 
 
541 aa  66.2  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  28.4 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  34.58 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  34.58 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  34.78 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  34.95 
 
 
237 aa  62.4  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.75 
 
 
247 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  30.29 
 
 
638 aa  61.2  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.58 
 
 
296 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  30.23 
 
 
243 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.05 
 
 
264 aa  60.5  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.38 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 
276 aa  60.1  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  23.08 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3114  Methyltransferase type 12  25.2 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.78 
 
 
250 aa  59.3  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  33.64 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  32.58 
 
 
242 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  33.64 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  33.64 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0105  methyltransferase type 11  31.37 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  31.3 
 
 
249 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.28 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  36.64 
 
 
177 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  36 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.19 
 
 
259 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  25.51 
 
 
252 aa  55.5  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
319 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  33.64 
 
 
237 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  33.64 
 
 
237 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1543  methyltransferase type 11  28.93 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.82 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  36.51 
 
 
256 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
270 aa  55.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  26.43 
 
 
221 aa  55.1  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 
280 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  29.41 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  32.73 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  32.73 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  31.3 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  29.41 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  26.03 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1008  hypothetical protein  24.37 
 
 
270 aa  53.9  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.823192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.16 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  33.04 
 
 
237 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  28.35 
 
 
281 aa  53.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  30.53 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  26.64 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  27.31 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>