More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_08556 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  100 
 
 
243 aa  501  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  61.51 
 
 
254 aa  308  5e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  49.37 
 
 
245 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  46.72 
 
 
246 aa  241  9e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  43.93 
 
 
255 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 
246 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  31.33 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
261 aa  135  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
262 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  30.2 
 
 
280 aa  126  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  29.51 
 
 
259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  31.43 
 
 
262 aa  124  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  29.39 
 
 
262 aa  122  5e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  32.52 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  29.1 
 
 
253 aa  89.4  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  24.42 
 
 
251 aa  82.8  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30.07 
 
 
286 aa  78.2  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  35.82 
 
 
248 aa  77.4  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  23.64 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.1 
 
 
256 aa  73.9  0.000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  38.14 
 
 
663 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  24.09 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  27.75 
 
 
243 aa  72  0.000000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  41.61 
 
 
637 aa  70.1  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  24.09 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.16 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
304 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  33.65 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  23.56 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  27.19 
 
 
252 aa  63.2  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  21.29 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
241 aa  62.8  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 
271 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  24.89 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.76 
 
 
250 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  38.26 
 
 
247 aa  62.4  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  24.89 
 
 
249 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.89 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  26.8 
 
 
257 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  28.91 
 
 
243 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  24.46 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.46 
 
 
249 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
675 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 
253 aa  58.9  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.26 
 
 
244 aa  58.9  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.19 
 
 
259 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 
250 aa  58.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.32 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.32 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  23.61 
 
 
249 aa  57.8  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.28 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  33.04 
 
 
267 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  21.26 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.35 
 
 
232 aa  55.8  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  22.83 
 
 
258 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  29.13 
 
 
279 aa  54.7  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
237 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  38.6 
 
 
198 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  24.88 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  33.33 
 
 
226 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.56 
 
 
296 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
220 aa  53.1  0.000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.31 
 
 
244 aa  53.1  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  19.81 
 
 
250 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  33.33 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
221 aa  52.8  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  22.49 
 
 
264 aa  53.1  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  36.76 
 
 
196 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  32.69 
 
 
190 aa  52.4  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  32.41 
 
 
226 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  40.74 
 
 
190 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30 
 
 
266 aa  52  0.000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  26.77 
 
 
247 aa  52  0.000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  19.81 
 
 
250 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  19.81 
 
 
250 aa  52  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  36.25 
 
 
189 aa  52  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  32.41 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
167 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  32.41 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 
267 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  31.48 
 
 
236 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  21.92 
 
 
246 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  28.93 
 
 
281 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  20 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  23.53 
 
 
280 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  31.48 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0098  methyltransferase type 11  22.71 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.972554  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  30.53 
 
 
242 aa  51.2  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>