More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4732 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  100 
 
 
241 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  47.03 
 
 
237 aa  191  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  42.08 
 
 
237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  42.62 
 
 
243 aa  160  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  38.08 
 
 
242 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  46.67 
 
 
246 aa  145  8.000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  44.44 
 
 
152 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.34 
 
 
249 aa  89.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
257 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  26.46 
 
 
248 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  26.87 
 
 
286 aa  77.4  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  36.36 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  43.75 
 
 
270 aa  68.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 
248 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.4 
 
 
390 aa  64.7  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  30.25 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
281 aa  62.4  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.58 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.88 
 
 
296 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  39.13 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  37.4 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  34.72 
 
 
247 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  30.43 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  39.8 
 
 
202 aa  58.2  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  28.57 
 
 
249 aa  58.5  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  31.63 
 
 
272 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  24.18 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 
315 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
285 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
215 aa  56.6  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
285 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  26.61 
 
 
220 aa  55.5  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  36.46 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
319 aa  55.5  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  28.18 
 
 
239 aa  55.1  0.0000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  32.74 
 
 
239 aa  54.7  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  28.93 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  42.71 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  32.84 
 
 
218 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
305 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  27.74 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  27.74 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  27.74 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  27.74 
 
 
249 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  25.75 
 
 
262 aa  53.9  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
337 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  27.74 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  32.08 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  37.9 
 
 
268 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.09 
 
 
269 aa  54.3  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  26.22 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  39.64 
 
 
291 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3068  Methyltransferase type 12  30.87 
 
 
288 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.448728 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4275  methyltransferase type 11  37.19 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  27.52 
 
 
255 aa  53.1  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  38.05 
 
 
222 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
252 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  27.73 
 
 
261 aa  52.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  35.09 
 
 
209 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  27.46 
 
 
232 aa  52  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  30.25 
 
 
247 aa  52  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  26.61 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  26.61 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.71 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2052  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.782296  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  39.8 
 
 
214 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.89 
 
 
258 aa  51.6  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.28 
 
 
249 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  27.01 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 
262 aa  50.8  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  27.01 
 
 
249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  24.37 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0757  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 
209 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000851252  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  35.38 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  30.48 
 
 
198 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
261 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  32.29 
 
 
263 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  31.39 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  26.05 
 
 
247 aa  51.2  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4692  methyltransferase type 11  34.35 
 
 
259 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.197255  normal  0.0428157 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  27.4 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 
269 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2836  glycosyl transferase family protein  28.81 
 
 
1759 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0244809 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>