More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4343 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 
259 aa  508  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  25.86 
 
 
247 aa  90.1  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  24.51 
 
 
248 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  26.09 
 
 
247 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  24.42 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  23.94 
 
 
245 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  23.94 
 
 
245 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.3 
 
 
249 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.72 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  32.65 
 
 
257 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  26.95 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.35 
 
 
275 aa  78.2  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.54 
 
 
266 aa  77.4  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.56 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.56 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.56 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.56 
 
 
269 aa  76.3  0.0000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.56 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.56 
 
 
249 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  22.31 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  22.31 
 
 
238 aa  75.5  0.0000000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.78 
 
 
249 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  26.51 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25.29 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.29 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.68 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  26.77 
 
 
244 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  22.61 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  21.21 
 
 
272 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  27.08 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0629  hypothetical protein  26.56 
 
 
239 aa  67  0.0000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.41007  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.69 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.71 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  46.34 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  28.65 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0646  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.94 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  31.36 
 
 
259 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
276 aa  63.2  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  29.44 
 
 
253 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  38.24 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 
233 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  27.91 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  36.5 
 
 
205 aa  60.5  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  26.35 
 
 
241 aa  60.1  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  28.93 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  35.58 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.28 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
255 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.77 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  47.83 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  35.24 
 
 
242 aa  58.5  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  30.19 
 
 
243 aa  58.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
280 aa  58.5  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  25.88 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  30 
 
 
286 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
232 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  26.95 
 
 
247 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
220 aa  57.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
232 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.23 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  42.11 
 
 
210 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  26.24 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1313  biotin biosynthesis protein BioC  35 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.110955  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  35.64 
 
 
246 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  23.61 
 
 
246 aa  57.4  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.13 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  35.8 
 
 
200 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.28 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.02 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  35.35 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  35.35 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  27.14 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  43.37 
 
 
249 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  45.65 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3007  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
429 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  31.19 
 
 
245 aa  55.8  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
244 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  24.48 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  39.67 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.25 
 
 
233 aa  55.8  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  28.57 
 
 
247 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.31 
 
 
238 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  24.83 
 
 
246 aa  55.5  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  37.89 
 
 
259 aa  55.5  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  34.29 
 
 
260 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  23.92 
 
 
248 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  60 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  34.34 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  49.15 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2579  transcriptional regulator, ArsR family  31.63 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  24.03 
 
 
280 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  23.78 
 
 
250 aa  55.5  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  44.64 
 
 
541 aa  55.5  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.71 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>