More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1844 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
251 aa  491  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  79.57 
 
 
243 aa  361  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  76.35 
 
 
244 aa  347  9e-95  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  76.15 
 
 
243 aa  344  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  78.45 
 
 
233 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.36 
 
 
236 aa  305  6e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.22 
 
 
233 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.79 
 
 
233 aa  291  8e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.93 
 
 
233 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.66 
 
 
233 aa  286  1e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.36 
 
 
233 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  63.04 
 
 
233 aa  275  7e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  58.8 
 
 
234 aa  264  8.999999999999999e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.68 
 
 
227 aa  229  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  50.43 
 
 
229 aa  215  5e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.56 
 
 
222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.56 
 
 
222 aa  212  4.9999999999999996e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.11 
 
 
222 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.6 
 
 
237 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.74 
 
 
231 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  38.3 
 
 
237 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.72 
 
 
233 aa  125  8.000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.84 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.16 
 
 
232 aa  121  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.53 
 
 
233 aa  121  9.999999999999999e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  34.2 
 
 
232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.69 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.73 
 
 
229 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30 
 
 
232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.76 
 
 
231 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.76 
 
 
231 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.73 
 
 
228 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  31.36 
 
 
228 aa  105  9e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.18 
 
 
228 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.21 
 
 
233 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.63 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.97 
 
 
226 aa  93.2  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.65 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  26.64 
 
 
235 aa  90.9  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.43 
 
 
237 aa  89.4  5e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  24.45 
 
 
232 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  23.91 
 
 
233 aa  87.4  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.57 
 
 
237 aa  85.9  6e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  24.02 
 
 
233 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  23.95 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.92 
 
 
237 aa  84  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.41 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  28 
 
 
258 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.17 
 
 
239 aa  62  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  34.35 
 
 
275 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0927  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  34.09 
 
 
241 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0924  Methyltransferase type 11  44.12 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.132405  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  41.49 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  35 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.24 
 
 
246 aa  56.2  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  36.57 
 
 
218 aa  56.2  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  40.24 
 
 
246 aa  56.6  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.28 
 
 
259 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1309  Cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  36.56 
 
 
423 aa  55.8  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  44.83 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  38.81 
 
 
268 aa  55.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  42.71 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.46 
 
 
238 aa  55.8  0.0000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5144  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.61 
 
 
394 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.278517  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  33.57 
 
 
344 aa  55.1  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.65 
 
 
253 aa  55.5  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1088  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 
251 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5586  Methyltransferase type 11  39.47 
 
 
253 aa  55.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.196982  hitchhiker  0.00869296 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0100  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.58 
 
 
253 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.294916 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  34.44 
 
 
269 aa  55.1  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0876  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
253 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.43 
 
 
424 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.59 
 
 
229 aa  54.7  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0172  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
991 aa  54.3  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 
252 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5666  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.2 
 
 
395 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.228934  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0515  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.63 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0440194 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  36.61 
 
 
243 aa  53.1  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  36.47 
 
 
276 aa  53.5  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.16 
 
 
434 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.18 
 
 
258 aa  52.8  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1285  hypothetical protein  38.46 
 
 
262 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0843441  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5813  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  52.8  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288082  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.98 
 
 
247 aa  52.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  40.3 
 
 
268 aa  52.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.93 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.93 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.42 
 
 
220 aa  52.4  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.93 
 
 
249 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  37.78 
 
 
256 aa  52  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  29.25 
 
 
249 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  29.25 
 
 
249 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5273  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.58 
 
 
418 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.44 
 
 
267 aa  51.2  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2011  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  39.13 
 
 
253 aa  52  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.3567 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0079  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.34 
 
 
253 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0762202 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>