More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_5357 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_5357  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  100 
 
 
243 aa  479  1e-134  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4812  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  90.12 
 
 
244 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.1747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5279  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  88.89 
 
 
243 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  79.57 
 
 
251 aa  361  4e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3722  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  77.83 
 
 
233 aa  328  4e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0542576 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0619  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  68 
 
 
236 aa  315  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00265376  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2038  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  66.96 
 
 
233 aa  300  1e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64.44 
 
 
233 aa  292  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3732  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64 
 
 
233 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.254048  hitchhiker  0.00379668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3977  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  64 
 
 
233 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296594  normal  0.175655 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1317  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.67 
 
 
233 aa  284  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.615277  normal  0.153656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6413  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  62.39 
 
 
233 aa  274  9e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1633  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  60.53 
 
 
234 aa  265  7e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.879034  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  53.85 
 
 
227 aa  226  2e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.38 
 
 
229 aa  216  4e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.21 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  52.21 
 
 
222 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1006  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  51.08 
 
 
222 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.788103  normal  0.633954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1907  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.84 
 
 
237 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2208  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.27 
 
 
233 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.44599  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1539  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  36.55 
 
 
237 aa  126  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000799051 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1975  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.28 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.611678 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2314  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.86 
 
 
231 aa  119  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0251558  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.19 
 
 
232 aa  119  6e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0965  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.57 
 
 
229 aa  118  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.145121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.49 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.969271  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0252  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.78 
 
 
232 aa  116  3e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2584  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.49 
 
 
232 aa  115  8.999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0439  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  32.97 
 
 
229 aa  109  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4469  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.11 
 
 
228 aa  106  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.281144  normal  0.152324 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3899  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.22 
 
 
228 aa  105  6e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.837605  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3415  magnesium protoporphyrin O-methyltransferase  28.83 
 
 
228 aa  105  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02431  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.76 
 
 
233 aa  104  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1536  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.33 
 
 
233 aa  104  2e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4433  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.27 
 
 
231 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.112508 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4371  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.27 
 
 
231 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01881  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.78 
 
 
232 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.155533  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35500  predicted protein  28.14 
 
 
235 aa  99.8  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.886527 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2425  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.03 
 
 
237 aa  100  3e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0288212  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0170  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.83 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.493478  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  26.36 
 
 
233 aa  97.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.40434  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27151  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.25 
 
 
237 aa  97.4  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01971  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  25.94 
 
 
232 aa  94  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01861  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  30.53 
 
 
237 aa  92.4  5e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1283  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.89 
 
 
226 aa  91.7  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.123635  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2105  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  28.21 
 
 
237 aa  91.7  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1601  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  27.27 
 
 
253 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_18872  magnesium-protoporphyrin IX methyltransferase  26.2 
 
 
258 aa  87.8  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.333886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  41.59 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2530  Methyltransferase type 11  37.27 
 
 
262 aa  62  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00109917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1691  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
262 aa  61.2  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  39.82 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.12 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  37.12 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  41.28 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00940  hexaprenyldihydroxybenzoate methyltransferase, putative  34.96 
 
 
344 aa  60.1  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  33.08 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.8 
 
 
253 aa  59.7  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 
230 aa  59.3  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  37.31 
 
 
218 aa  59.3  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  42.73 
 
 
252 aa  59.7  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40 
 
 
252 aa  58.9  0.00000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2130  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.76 
 
 
241 aa  58.9  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.874721 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.11 
 
 
230 aa  58.5  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5595  Methyltransferase type 11  32.97 
 
 
239 aa  58.9  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
246 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
246 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0907  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4274  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
243 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.533221  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.43 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  37.27 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2384  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  56.6  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.528666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.25 
 
 
266 aa  55.8  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  37.6 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7600  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  45.68 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.906312  normal  0.192206 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2236  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.56 
 
 
253 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0596269  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6010  methyltransferase type 11  36.84 
 
 
246 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1561  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  38.52 
 
 
256 aa  55.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676344 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  37.29 
 
 
267 aa  55.5  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.82 
 
 
268 aa  55.5  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.68 
 
 
220 aa  55.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.55 
 
 
232 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  38.38 
 
 
251 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.44 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  40.58 
 
 
252 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.36 
 
 
244 aa  53.9  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1676  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  39.78 
 
 
243 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257047  normal  0.49664 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2592  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.94 
 
 
424 aa  53.9  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  34.65 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2157  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  38.24 
 
 
434 aa  54.3  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016063  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.44 
 
 
243 aa  53.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3209  ArsR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
341 aa  53.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2116  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
251 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.518004  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  37.89 
 
 
440 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.95 
 
 
247 aa  53.9  0.000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.23 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  39.53 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  34.43 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.82 
 
 
269 aa  52.8  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>